第六节代谢能对微生物生长和维持的支撑

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1、第六节 代谢能对微生物生 长和维持的支撑 Date1张星元:发酵原理 涉及微生物细胞的生长和繁殖的 每一个“动作”,包括细胞内有机化合 物降解的启动、生物合成的启动和继 续、主动输送、细胞内 pH 自动动态 平衡等都需要代谢能的支撑,同样维 持细胞的生命也需要代谢能的支撑。 Date2张星元:发酵原理 没有生命活动就没有代谢 能。没有代谢能就没有生命, 没有代谢能就没有微生物的生 命活动,就没有工业发酵。 Date3张星元:发酵原理 2.6.1 微生物细胞的生长能学 2.6.2 用于维持的ATP消耗 2.6.3 微生物能量的储存 Date4张星元:发酵原理 2.6.1 微生物细胞的生长能学 生

2、长能学(growth energetics )描述了通常以ATP的形式出现的 代谢能的产生与消耗的关系,因此 涉及到主动输送(包括输入和输出 )、供能反应(fueling reactions) 、生物合成反应、大分子合成反应 和细胞组装反应。 Date5张星元:发酵原理 2.6.1.1 前体代谢物的代谢成本 2.6.1.2 分子模块等的代谢成本 2.6.1.3 生物大分子的代谢成本 2.6.1.4 整个细胞的代谢成本 Date6张星元:发酵原理 2.6.1.1前体代谢物的代谢成本 依据运输、生物合成和聚合的代 谢成本的估计值,有可能计算出细胞 合成所需的ATP总量和 NADPH 的总 量。这种

3、计算是以碳源(通常是葡萄 糖)为基础的,首先计算12种前体代 谢物(将在第三章讲述)。这12种前 体代谢物是微生物通过能量供应反应 从碳源生成的。 Date7张星元:发酵原理 2.6.1.2 模块分子等的代谢成本 研究细胞经济运行,当然要研 究代谢的成本,包括多肽和蛋白质 的结构单元氨基酸生物合成的代谢 成本,核酸的结构单元核苷酸生物 合成的代谢成本,以及脂类和糖类 结构单元的生物合成的代谢成本 。 这些分子模块都是从前体代谢物出 发合成的。 Date8张星元:发酵原理 2.6.1.3 生物大分子的代谢成本 在细胞的经济运行中,既要讨论 全局的通用代谢物的作用,也要讨论 细胞物质合成的成本。这

4、里将讨论合 成生物大分子的代谢成本。 Date9张星元:发酵原理 组成细胞的生物大分子可分成以 下几类: RNA;DNA;蛋白 质;碳水化合物(糖类);氨基 碳水化合物(氨基糖类);脂类。 生物大分子的组成随生物种类的不同 而不同,对于一个给定的生物物种, 其大分子组成随比生长速率和环境条 件的改变而改变。 Date10张星元:发酵原理 蛋白质合成的成本 在延伸的肽链上添加 1个 氨基酸 需要利用 4 个高能磷酸键,相当于 4 个ATP。此外,在从mRNA合成与校 对等过程中还需要一些自由能,总计 每结合 1个氨基酸约需0.3个ATP。因 此在多肽生成过程中,在延伸的肽链 上每添加 1 个氨基

5、酸一共要消耗 4.3 个ATP。 Date11张星元:发酵原理 核糖核酸(RNA)合成的成本 收编1个核苷酸(以单磷酸核苷酸 计)的代谢能成本为2.4个ATP。 脱氧核糖核酸(DNA)合成的成本 结合1个脱氧核糖核苷酸(以单磷 酸核苷酸计)的总能耗为3.4个ATP。 磷脂等的生物合成成本(略) Date12张星元:发酵原理 2.6.1.4 整个细胞的代谢成本 如果用于形成前体代谢物、模块 分子和生物大分子的代谢成本已知, 那么就可以计算出合成整个细胞所需 的ATP。 Date13张星元:发酵原理 2.6.2 用于维持的ATP消耗 Date14张星元:发酵原理 许多细胞反应需要消耗ATP,但 这

6、些反应对菌体的净合成并没有贡献 ,通常把这些反应称为维持反应或维 持过程。其中有一些维持反应与生长 有关,例如用于维持细胞质膜的跨膜 的电化学梯度的反应,而其他维持反 应(如生物大分子的周转和更新)与 细胞的比生长速率是无关的。 Date15张星元:发酵原理 2.6.2.1 浓度梯度和电位梯度的 维持 2.6.2.2 无效循环 2.6.2.3 大分子的周转和更新 Date16张星元:发酵原理 2.6.2.1浓度梯度和电位梯度的维持 为确保适当的功能,细胞要维持 各种跨膜的浓度梯度和电化学梯度, 包括跨质膜的浓度梯度和电化学梯度 ,跨真核细胞线粒体膜的浓度梯度和 电化学梯度。这些过程需要代谢能,

7、 但不会导致新菌体量的合成,因此是 维持过程的典型例子。 Date17张星元:发酵原理 这些过程中有一部分是与生长 相关的,例如细胞膨胀变大时,增 大的面积(或体积)上的电位梯度 要得到维持;但也有一部分是与生 长无关的,即当细胞不生长时梯度 也需要维持。 维持梯度的 ATP 消 耗估计可达生成ATP总量的的50% 。 Date18张星元:发酵原理 2.6.2.2 无效循环 细胞内有些反应序列,其净结果 是ATP 的水解。例如6-磷酸果糖在磷 酸果糖激酶的作用下生成 1,6 -二磷酸 果糖,1,6 - 二磷酸果糖在二磷酸果糖 磷酸酯酶的作用下,又被降解成 6-磷 酸果糖。这两步反应导致ATP的

8、净消 耗。 Date19张星元:发酵原理 这类循环最初被当作是代谢控制 的一个缺陷(因此被称为无效循环) ,但目前这种循环被认为是一种重要 的代谢控制机制。当两种酶都存在时 ,这种循环能使细胞迅速地进行自我 调整以适应新环境条件。 Date20张星元:发酵原理 2.6.2.3大分子的周转和更新 细胞需要不断降解和合成许多 分子,以维持其对代谢功能的控制 能力。因此mRNA的半衰期只有的 几分钟。大分子的这种连续的降解 和再聚合,导致了ATP的净消耗, 而没有新生物量的产生,因此,也 被认为是一种维持过程。 Date21张星元:发酵原理 2.6.3 微生物能量的贮存 Date22张星元:发酵原理

9、 当有多余营养物质存在时,微生物常 常改变它们的某些代谢方向,合成一些化 合物,作为能量贮存。当氮源或其他必需 离子限量而碳和能量物质仍然可以被利用 时,也生成大量的贮备化合物。饥饿时可 以降解这些化合物,以释放能量,维持生 存。一般情况下,不到细胞内氨基酸和核 苷酸库不能再维持下去的时候,这些贮藏 物是不动用的。这些化合物大致可以分成 以下几类。 Date23张星元:发酵原理 2.6.3.1 碳水化合物的贮藏 2.6.3.2 脂类的贮藏 2.6.3.3 多聚偏磷酸 Date24张星元:发酵原理 2.6.3.1 碳水化合物的贮藏 在真菌及细菌中,包括某些蓝细菌中 ,发现的贮存化合物是海藻糖(t

10、rehalose ),一种非还原性的双糖。 在酵母及黏菌( slime moulds )中碳 水化合物则以糖原的方式存在。糖原在营 养生长阶段堆积起来,到生长发育阶段, 导致孢子形成时,这些储备物就用来提供 能量。 Date25张星元:发酵原理 在许多微生物中发现糖原存在,特在许多微生物中发现糖原存在,特 别是在能量丰富营养不平衡的时候,就别是在能量丰富营养不平衡的时候,就 有相当大量的糖原堆积。糖原合成的机有相当大量的糖原堆积。糖原合成的机 制在原核生物和真核生物中是不同的。制在原核生物和真核生物中是不同的。 在原核细胞中,葡糖基(在原核细胞中,葡糖基( glycosylglycosyl )

11、的的 供体是供体是 ADP-ADP-葡萄糖,而不是葡萄糖,而不是UDP-UDP-葡萄葡萄 糖(原核细胞中糖(原核细胞中 UDP - UDP - 葡萄糖用来合成葡萄糖用来合成 细胞壁)。细胞壁)。 Date26张星元:发酵原理 2.6.3.2 脂类的贮藏 在原核细胞中,多聚 - 羟基丁酸 ( poly -hydroxybutyrate,PHB ) 是最普通的脂类贮存化合物,在光合细 菌、蓝细菌和许多其他原核细胞中都有 大量堆积。 在有较大的芽孢的芽孢杆菌中,包 括蜡状芽孢杆菌( B.cereus )及巨大芽 孢杆菌(B.megaterium ),PHB是生孢 子的主要贮存化合物。 Date27张

12、星元:发酵原理 PHB PHB 是一种线形多聚体(是一种线形多聚体( 可达可达 菌体干重的菌体干重的 60 % 60 % ),它的降解需要),它的降解需要 蛋白水解酶使蛋白水解酶使 PHB PHB 颗粒活化,颗粒活化, 随后随后 被被 PHB PHB 解聚酶(解聚酶(depolymerasedepolymerase)水水 解成二聚体,最后切成单体。解成二聚体,最后切成单体。 真核细胞中没有发现真核细胞中没有发现 PHB PHB ,却却 有有中性脂中性脂类的堆积。类的堆积。 Date28张星元:发酵原理 2.6.3.3 多聚偏磷酸 在许多微生物中,包括真核及原核 生物,在异染粒(volutin)

13、颗粒中发现 有多聚偏磷酸( polymetaphosphate ) ,这种多聚体同时起磷酸贮存及能量贮 存的作用,因为磷酸酐键水解时具有很 高的自由能。 Date29张星元:发酵原理 代谢能的持续供应是微生物代谢能的持续供应是微生物 生命活动的前提,代谢能支撑是生命活动的前提,代谢能支撑是 工业发酵运行的立足点。工业发酵运行的立足点。 代谢能支撑假说揭示了化能代谢能支撑假说揭示了化能 异养型微生物细胞的能量代谢的异养型微生物细胞的能量代谢的 氧化还原本质,确定了工业发酵氧化还原本质,确定了工业发酵 的生物学属性。确立了微生物活的生物学属性。确立了微生物活 细胞在发酵生产中的核心地位。细胞在发酵

14、生产中的核心地位。 Date30张星元:发酵原理 复习题 1. 试述代谢能支撑假说的要点。 2. 试比较真核细胞与原核细胞细胞内部的空 间分隔,讨论真核细胞的跨膜输送的复杂性 。 3. 试比较微生物细胞进行有氧呼吸与发酵时 ,还原剂分子释放的电子转移到最终电子受 体的过程。 4. 为什么说“无氧发酵”的说法是不准确的? 5. 为什么脱氢酶的辅酶必须被再生和回用? Date31张星元:发酵原理 6. 使用形象思维的方式对直接化学耦合、 电耦合和还原当量耦合进行比较。 7. 试画出并讨论支持细胞生命活动的质子 回路。 8. 为什么说代谢能的持续供应是微生物生 命活动的前提? 9. 为什么说代谢能支撑假说揭示了化能异 养型微生物细胞的能量代谢的氧化还原本 质,确定了工业发酵的生物学属性,确立 了微生物活细胞在发酵生产中的核心地位 ? Date32张星元:发酵原理

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