烟草核心种质库构建及遗传多样性研究

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1、 分类号: S330 单位代码: 10335 密 级: 学 号: 20916038 硕士学位论文硕士学位论文 中文论文题目:中文论文题目: 烟草核心种质库构建及遗传多样性研究烟草核心种质库构建及遗传多样性研究 英文论文题目:英文论文题目: Genetic Diversity and Core Collection Construction of Tobacco Germplasm Resources 申请人姓名: 周佳萍 指导教师: 徐海明 副教授 专业名称: 作物学 研究方向: 生物统计与数量遗传学 所在学院: 农业与生物技术学院 论文提交日期论文提交日期 2012 年年 6 月月 浙江大学

2、硕士学位论文 i 分类号: S330 单位代码: 10335 密 级: 学 号: 20916038 硕士学位论文硕士学位论文 中文论文题目:中文论文题目: 烟烟草核心种质库构建及遗传多样性研究草核心种质库构建及遗传多样性研究 英文论文题目:英文论文题目: Genetic Diversity and Core Collection Construction of Tobacco Germplasm Resources 申请人姓名: 周佳萍 指导教师: 徐海明 副教授 专业名称: 作物学 研究方向: 生物统计与数量遗传学 所在学院: 农业与生物技术学院 论文提交日期论文提交日期 2012 年年 6

3、 月月 浙江大学硕士学位论文 ii A Dissertation submitted to Zhejiang University in partial fulfillment of the requirementsfor the degree of Master of Agronomy Genetic Diversity and Core Collection Construction of Tobacco Germplasm Resources by Zhou Jiaping Major:Crop Science (Plant Genetics and Breeding) Zhejiang

4、 University, Hangzhou, P. R. China, 310058 June, 2012 浙江大学硕士学位论文 iii 烟草核心种质库构建及遗传多样性研究烟草核心种质库构建及遗传多样性研究 论文作者签名论文作者签名: 指导教师签名指导教师签名: 论文评阅人 1: 楼向阳 副教授 评阅人 2: 吴家胜 教授 评阅人 3: 吴建国 副教授 评阅人 4: 答辩委员会主席: 樊龙江 教授 委员 1: 朱军 教授 委员 2: 赵坚义 研究员 委员 3: 答辩日期: 2012 年 5 月 23 日 浙江大学硕士学位论文 iv Genetic Diversity and Core Coll

5、ection Construction of Tobacco Germplasm Resources Authors signature: Supervisors signature: External Reviewers: Xiangyang Lou Associate Professor Jiasheng Wu Professor Jianguo Wu Associate Professor Examining Committee Chairperson: Longjiang Fan Professor Examining Committee Members: Jun Zhu Profes

6、sor Jianyi Zhao Researcher Date of oral defence: May 23, 2012 浙江大学硕士学位论文 v 浙江大学研究生学位论文独创性声明 本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的 研究成果。除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发 表或撰写过的研究成果, 也不包含为获得 浙江大学浙江大学 或其他教育机构的学位或 证书而使用过的材料。 与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文 中作了明确的说明并表示谢意。 学位论文作者签名: 签字日期: 年 月 日 学位论文版权使用授权书 本学位论文作者完全了解

7、浙江大学浙江大学 有权保留并向国家有关部门或机 构送交本论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权 浙江大学浙江大学 可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索和传播, 可以采用影 印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。 (保密的学位论文在解密后适用本授权书) 学位论文作者签名: 导师签名: 签字日期: 年 月 日 签字日期: 年 月 日 浙江大学硕士学位论文 致谢 vi 致致 谢谢 本研究是在导师徐海明老师的亲切关怀和悉心指导下完成的, 导师诲人不倦 的高尚师德, 严以律己、 宽以待人的崇高风范, 朴实无华、 平易近人的人格魅力, 严谨的治学态度,一丝不苟、废寝忘食的

8、工作作风,开拓创新的科学精神给我留 下了不可磨灭的印象。 不仅使我树立了远大的学术目标, 掌握了基本的研究方法, 还让我明白了许多为人处世与待人接物的道理。本论文从选题、定题一直到最后 修改、润色,徐老师始终耐心负责地加以指导,帮助我开拓研究思路,在此十分 感激徐老师的细心指导,才能让我顺利完成毕业论文。徐老师不仅在学业上给以 悉心指导,同时还在思想和生活方面给我以无微不至的关怀,在此谨向徐老师致 以诚挚的谢意和崇高的敬意! 本研究所用的实例数据均来自于贵州烟草研究所, 在此向任学良副所长及所 有参与烟草数据收集的工作者表示诚挚的感谢。学习期间还得到了朱军教授、樊 龙江教授、石春海教授、胡晋教

9、授、祝水金教授、周伟军教授、凃巨民教授、袁 熙贤老师、洪彩霞老师、吴晓晶老师和张帆老师的帮助和教导,在此表示深深的 感谢。 衷心感谢师兄弟(姐妹)金谷雷、朱智宏、张福涛、童晓然、刘海岚、曹培 健、叶成荫,徐利锋、梁媚媚、魏恒玲、张陈皓、朱智翔、马亚楠、余世洲、王 继变、周莉媛、祁婷、李丽萍等对我的学习和科研的关心和支持,感谢 BCL 实 验室欢声笑语的共同营造者,以及为实验室提供便利的同学。 在学习期间浙江大学农学系、 农学院各科室的领导和老师对我的学习和研究 工作给予了极大的支持和帮助。感谢我的室友李冠、邓香芹、许露露对我生活上 的关心。感谢男友曹方彬对我的支持和关爱。 还要特别感谢我的父母

10、,他们都是农民,用微薄的收入节衣缩食供我和妹妹 上大学,给我们创造了良好的学习和生活环境。在未来的日子里,我会更加努力 的学习和工作,不辜负父母对我的殷切期望! 最后,再次感谢曾给予我关心、帮助和支持的所有提及和没有提及的老师、 家人、朋友和同学。 周佳萍 2012 年 4 月于浙大紫金港 浙江大学硕士学位论文 摘要 vii 摘摘 要要 中国是烟草种质资源大国,目前中国烟草种质资源平台保存烟草种质资源 5300 多份,独家保存量居世界首位。庞大的资源数量给烟草种质的保存、评价、 研究以及利用带来许多不便。 烟草核心种质的构建对促进烟草种质资源的进一步 收集保存、优异种质挖掘以及烟草遗传育种均具

11、有非常重要的意义。核心种质构 建的关键是准确地评价不同材料间的遗传差异以及合理的抽样策略, 本研究从烟 草农艺性状着手,比较不同构建方法所得核心子集的遗传多样性保留量,筛选出 最佳抽样策略; 结合 SRAP 分子标记比较不同数据类型的核心子集的多样性指标; 最后整合农艺性状与运用性状-位点关联分析找到的显著相关位点完成烟草核心 种质库构建。主要研究内容和结论如下: 1以贵州省烟草科学研究所 805 份烟草种质为试验材料,2006 年分别在贵 州金沙和福泉两个试验点进行多点田间试验。采用包括基因型、环境、基因环 境互作效应的混合线性模型及AUP法无偏预测烟草12个农艺性状的基因型效应 值。用基因

12、型值计算不同品种之间的马氏距离,比较 5 种不同系统聚类方法(最 短距离、最长距离法、重心法、类平均法以及离差平方和法) 、2 种抽样方法(优 先取样法和变异度取样法) 以及 5 种抽样比率 (5%30%) 下核心子集的多样性, 用均值、方差、极差和变异系数比较不同组合方法构建核心种质的代表性。结果 表明:采用变异度取样法构建的核心子集不能很好地代表原始群体,优先取样法 有利于保存具有性状极端的材料; 重心法进行系统距离能最大限度地保存原有烟 草群体的遗传多样性, 是构建核心种质较好的系统聚类方法; 在 10%的抽样比率 下所构建的核心子集的遗传多样性指数达到最大。 通过主成分分析法比较核心种

13、 质与原始群体样本分布的空间结构与特征, 运用相关系数检验原始群体性状间的 遗传关系是否被核心种质很好地保留,结果表明由 81 份种质材料组成的核心种 质库能很好地代表烟草农艺性状的遗传多样性。 2.以 608 份具有完整农艺性状数据和 SRAP 分子标记数据的烟草种质资源为 分析材料,在 7 种抽样比例(10%40%)下运用农艺性状数据筛选的最佳构建 策略(重心法聚类+优先取样)分别构建基于烟草农艺性状、SRAP 分子标记以 浙江大学硕士学位论文 摘要 viii 及农艺性状整合分子标记数据的核心子集, 从分子标记多样性和农艺性状的遗传 变异综合评价不同子集。结果表明:仅用分子标记信息构建核心

14、种质库,不能准 确地度量群体农艺性状的遗传冗余度, 所构建的子集虽然具有更高的分子多样性, 但会丧失农艺性状的遗传变异;反之,仅用农艺性状信息能提高农艺性状的遗传 变异,但不能提高分子标记的多样性;而整合信息的核心子集不但能有效度量分 子水平上的差异,同时兼顾个体间数量性状变异,使农艺性状与分子标记的遗传 多样性同时提高。在此基础上,比较 Jaccard、Nei comparing the diversity indices among core subset based on three different types data combination with SRAP molecular marker; ascertaining the final core collection by integrating the agronomic traits and the SRAP loci which were associated with the agronomic traits. The main contents and conclusions of this study were summ

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