智能诊断报告系统

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1、华中科技大学 硕士学位论文 智能诊断报告系统 姓名:朱传聪 申请学位级别:硕士 专业:计算机应用技术 指导教师:宋恩民;金人超 2011-01-17 华华 中中 科科 技技 大大 学学 硕硕 士士 学学 位位 论论 文文 I 摘摘 要要 CT 诊断报告是放射科医生对 CT 图像结果的客观描述。随着计算机辅助诊断系 统的发展,CT 图像中肺部疾病辅助诊断已经在很大程度上减少放射科医生的工作量 以及单独阅片的疏漏,进而也带动了 CT 智能诊断报告的发展,智能诊断报告系统作 为放射科医生的“第二只笔” ,在配合其诊断的过程中也发挥了重要的作用。 手工书写的 CT 诊断报告费时严重,而且字迹潦草,不易

2、辨认,保存与检索十分 困难,已经广为医生以及病人所诟病,智能诊断报告系统正是为这些问题而开发的, 其核心内容是结构化报告 SR (Structured Report) , 它通过对 CT 诊断报告进行结构化 处理,分离出模板与数据部分,在计算机辅助诊断系统获得相关病理数据后,根据 实际需要自动填充模板,形成完整的诊断报告,准确性、高效性以及标准性使得其 比较于旧式的诊断报告录入方案有了巨大的改进,不仅为诊断医生节约了大量的时 间,而且还将诊断报告以计算机能够理解的方式进行存储,加大了诊断报告处理的 灵活性和持久性。提出了一种简化的可扩展标记语言 SXML(Simplified Extensib

3、le Markup Language),用于对诊断报告进行描述,各种诊断语句以及诊断结果通过标签 以及标签属性进行区分。静态的 SXML 文本称之为模板,而将 SXML 解析并填充数 据后便形成诊断报告的整体结构诊断报告树,诊断报告树是内存中的一棵树形 结构数据,通过某种方式对其进行操作则是对诊断报告进行了操作。系统以“所见 即所得”的方式对诊断报告系统进行操作,将诊断报告解释为一系列的内存界 面映射,并分配不同的操作方式,使得诊断报告的操作形象而且优雅。为了保证这 种方式的实施,使用了多态、泛型、委托函数表等技术,也使得其扩展性大大提高。 目前,系统已经在华中科技大学附属协和医院以及苏州大学

4、第二附属医院试用, 使用效果良好,受到医生好评。 关键词:关键词:诊断报告,结构化,所见即所得,模板 华华 中中 科科 技技 大大 学学 硕硕 士士 学学 位位 论论 文文 II Abstract The CT Diagnose Report is an impersonal description of CT images. With the development of CAD(Computer Aided Diagnose) system, not only the work load but also the oversights have been greatly reduced b

5、y the CAD system when doctors are diagnosing Lung disease from CT images. Also with that, intelligent diagnose reporting system develops too. As the Second Pen for doctors, intelligent diagnoses reporting system plays an import role in Lung disease diagnosing. As hand-writing CT diagnose report occu

6、pies a lot of time, difficult to identify and hard to be stored and indexed, it is castigated by doctors and patients. The intelligent diagnose reporting system is produced to solves these problems, its core content is Structured Report (SR), the report is translated into structured format, Template

7、 and Data has been separated. After getting the diagnose data from CAD system, all the data are filled into a proper template, and thus a whole report is generated. It is a great advance compared to old style report generation with its clarity, high-efficiency and standardization. It helps the docto

8、r save a lot of time, and still, it makes the computer understand what it saves, and thus makes the processing of diagnose report flexible and persistent. In this problem, a simple Extensible Markup Language called SXML is put forward to describe the diagnose report, each diagnose word is distinct i

9、n label and property. The static SXML text is called a Template and after filling with the diagnose data, a report tree structure will be build up in system memory as it represents a whole report, when we do operations on the report tree structure, we do operations on the real report. This system us

10、e a WYSIWYG (what you see is what you get) manner to operate on diagnose report, the system translate the report into a series of memory-GUI mapping, and allocate them with distinct operations, which makes the operations on report vivid and elegant. In order to implement this manner, a lot of techno

11、logies such as polymorphism, generic programming, delegate function table and so on, which in turn makes the system flexible. The system is now being used in The Xiehe Hospital of HUST and The 2nd hospital attached to Suzhou University, praised highly by doctors there. Keywords:Diagnose report, stru

12、ctured report, WYSIWYG,template 独创性声明独创性声明 本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研 究成果。尽我所知,除文中已经标明引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或 集体已经发表或撰写过的研究成果。对本文的研究做出贡献的个人和集体,均已在 文中以明确方式标明。本人完全意识到,本声明的法律结果由本人承担。 学位论文作者签名: 日期: 年 月 日 学位论文版权使用授权书学位论文版权使用授权书 本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权 保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅。

13、 本人授权华中科技大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检 索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。 保密 ,在_年解密后适用本授权书。 不保密。 (请在以上方框内打“” ) 学位论文作者签名: 指导教师签名: 日期: 年 月 日 日期: 年 月 本论文属于 华华 中中 科科 技技 大大 学学 硕硕 士士 学学 位位 论论 文文 1 1 绪论绪论 1.1 课题背景课题背景 CT 诊断报告是医生对 CT 图像以及诊断结果的客观描述,一般诊断报告的长度 为 200-400 字,采用人工书写的方式不仅重复率高,而且费时,效率低。如何快速、 准确、方便的进行诊断报告

14、录入一直是医学界研究的热点。计算机辅助诊断系统1,2 对 CT 图像进行处理后获取各种病理参数3,4,这些参数往往对应一定的诊断结果, 因此,如何有效的使用这些参数成为报告系统开发研究的重要内容。 诊断报告包含了大量反映病人疾病特征的病理信息,而且具有非常强的结构化 形式,即它们的表述存在一定的格式和风格,如果可以将诊断报告按照计算机明 确无误的结构方式组织起来,使计算机能够方便的管理和传递诊断报告5,6;使计 算机可以准确无误的理解和表达诊断报告中的概念7, 那么我们称这种报告方式为计 算机结构化的诊断报告8,9。 一方面,CT 诊断报告无论从内容还是形式上都非常符合结构化的要求,另一方 面

15、,对 CT 诊断报告进行结构化规范能够使 CT 诊断报告更容易理解,也更容易进行 标准化、 自动化,同时可以将 CT 诊断报告对不同人或者机器造成的误解降低到最低 层度。智能化诊断报告10-12正是在这一基础上实现的,其“智能化”通过以下几点 实现:诊断报告系统的数据源来自计算机辅助诊断系统,该系统通过各种先进的 算法与检测手段获取诊断病理信息;通过对大量诊断报告形式的归纳与总结,以 及它们对数据的处理手法上可以获得诊断报告书写的一般形式,称之为模板13,模 板有多种,不同的病理对应不同的模板。对于一个新的病例,只需要通过相关的处 理,即可决定需要使用的模板,套用该模板后,诊断报告就会自动生成

16、;生成的 诊断报告是可修改的,医生可以通过修改诊断报告中的某些描述来影响病理数据, 即计算机能够“理解”这些描述并做出对医生行为的响应;医生在处理诊断报告 的过程中所做出的修改会逐渐影响医生所使用的模板,最后每个医生都会形成自己 的模板,形成不同的风格,却依旧不失标准性与结构性。 计算机辅助诊断系统与诊断报告系统处理同样的数据病理数据,不同之处 华华 中中 科科 技技 大大 学学 硕硕 士士 学学 位位 论论 文文 2 在于,前者通过某种算法、经验或者操作获得病理数据,而后者则是通过这些病理 数据来生成不同的诊断报告内容。在 CT 诊断领域,计算机辅助诊断系统主要用于辅 助医生查看可能存在的病灶(结节、肿块) ,并获取病灶的形态、密度、大小等参数, 而诊断报

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