生物化学核苷酸代谢与核酸合成讲述

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1、第九章第九章 核苷酸代谢核苷酸代谢 n n 核苷酸的分解代谢核苷酸的分解代谢 n n 核苷酸的生物合成核苷酸的生物合成 一一 核苷酸的分解核苷酸的分解 n n 核酸的酶促降解核酸的酶促降解 n n 核苷酸的酶促降解核苷酸的酶促降解 (一)核酸的酶促降解(一)核酸的酶促降解 核酸酶 核酸酶 核酸核酸 核苷酸核苷酸 核酸内切酶核酸内切酶 DNADNA酶酶 核酸外切酶核酸外切酶 RNARNA酶酶 限制性内切酶限制性内切酶 (二)(二) 核苷酸的分解核苷酸的分解 1 1 核苷酸核苷酸 核苷核苷 + + 磷酸磷酸 2 2 核苷核苷 碱基碱基 + + 戊糖戊糖 3 3 碱基的分解碱基的分解 3 3 碱基的

2、分解碱基的分解 不同种类的生物分解碱基的能力不一样,因而不同种类的生物分解碱基的能力不一样,因而 代谢产物也各不相同。代谢产物也各不相同。 (1 1)嘌呤的分解)嘌呤的分解 灵长类、鸟类、某些爬行类和昆虫以尿酸为嘌灵长类、鸟类、某些爬行类和昆虫以尿酸为嘌 呤代谢的终产物。呤代谢的终产物。 (2 2)嘧啶的分解)嘧啶的分解 C C、U U -Ala-Ala T T - -氨基异丁酸氨基异丁酸 二二 核苷酸的生物合成核苷酸的生物合成 n n 无论是动物、植物还是微生物,都能合成自身需无论是动物、植物还是微生物,都能合成自身需 要的各种嘌呤和嘧啶核苷酸。要的各种嘌呤和嘧啶核苷酸。 n n 氨基酸、脂

3、肪酸的情况不一样,则有必需、非必氨基酸、脂肪酸的情况不一样,则有必需、非必 需之分。需之分。 n n 合成核酸合成核酸 需要的物质需要的物质 n n 核苷酸在细胞内的合成有两条基本途径:核苷酸在细胞内的合成有两条基本途径: 从头合成途径从头合成途径 补救作用补救作用 (一)嘌呤核苷酸的从头合成(一)嘌呤核苷酸的从头合成 生物体合成嘌呤环的前体有以下生物体合成嘌呤环的前体有以下5 5种:种: 碳氢盐或碳氢盐或COCO 2 2 、甲酸盐、甲酸盐、GlnGln、AspAsp、GlyGly。 n n 生物体不是先合成嘌呤碱基,再与核糖和磷酸结生物体不是先合成嘌呤碱基,再与核糖和磷酸结 合成核苷酸。合成

4、核苷酸。 n n 而是从而是从5-P-5-P-核糖焦磷酸(核糖焦磷酸(5-PRPP5-PRPP)开始,经过一)开始,经过一 系列酶促反应,生成次黄嘌呤核苷酸,然后再转系列酶促反应,生成次黄嘌呤核苷酸,然后再转 变为其他嘌呤核苷酸。变为其他嘌呤核苷酸。 (二)嘧啶核苷酸的合成(二)嘧啶核苷酸的合成 1 1 嘧啶环的合成嘧啶环的合成 嘧啶环合成的前体是:嘧啶环合成的前体是:COCO 2 2 、NHNH 3 3 、AspAsp。 2 2 嘧啶核苷酸的合成嘧啶核苷酸的合成 由乳清酸进一步转化而来。乳清酸是嘧啶核苷酸由乳清酸进一步转化而来。乳清酸是嘧啶核苷酸 合成的关键中间化合物。合成的关键中间化合物。

5、 (三)核苷酸转化为核苷三磷酸(三)核苷酸转化为核苷三磷酸 1 1 核苷酸核苷酸 核苷二磷酸核苷二磷酸 2 2核苷二磷酸核苷二磷酸 核苷三磷酸核苷三磷酸 (四)脱氧核苷酸的合成(四)脱氧核苷酸的合成 大多数生物是以核苷二磷酸为底物,以硫氧大多数生物是以核苷二磷酸为底物,以硫氧 还蛋白为还原剂。还蛋白为还原剂。 (五)(五)dTMPdTMP的合成的合成 n n 由由dUMPdUMP甲基化生成。甲基化生成。 n n 反应由胸苷酸合成酶催化,甲基供体为反应由胸苷酸合成酶催化,甲基供体为NN 5 5 ,NN10 10 - - 亚甲基四氢叶酸。亚甲基四氢叶酸。 第十章第十章 核酸的生物合成核酸的生物合成

6、 DNADNA的复制的复制 DNADNA的生物合成的生物合成 DNADNA的损伤和修复的损伤和修复 细菌的限制细菌的限制- -修饰酶系统修饰酶系统 反转录作用反转录作用 RNARNA的生物合成的生物合成 转录转录 RNARNA的复制的复制 一一 DNADNA的生物合成的生物合成 (一)(一)DNADNA的复制的复制 (replicationreplication) 指亲本指亲本DNADNA双螺旋解开,两条链分别作为双螺旋解开,两条链分别作为 模板,合成子代模板,合成子代DNADNA的过程。的过程。 1 DNA1 DNA的半保留复制的半保留复制 2 2 复制的起始点和方向复制的起始点和方向 3

7、3 原核细胞原核细胞DNADNA的复制的复制 4 4 真核细胞真核细胞DNADNA的复制的复制 1 DNA1 DNA的半保留复制(的半保留复制(semiconservative semiconservative replicationreplication) 概念:概念:DNADNA复制时两条链分开,然后用碱基配对方复制时两条链分开,然后用碱基配对方 式按照单链式按照单链DNADNA的核苷酸顺序合成新链,以组成的核苷酸顺序合成新链,以组成 新新DNADNA分子。这样新形成的两个分子。这样新形成的两个DNADNA分子与原来分子与原来 的的DNADNA分子的碱基顺序完全一样。每个子代分子分子的碱基

8、顺序完全一样。每个子代分子 的一条链来自亲代的一条链来自亲代DNADNA、另一条是新合成的。这、另一条是新合成的。这 种复制方式成为半保留复制。种复制方式成为半保留复制。 两个直接证据。两个直接证据。 2 2 复制的起始点、方向和速度复制的起始点、方向和速度 (1 1)复制子复制子 : 基因组中能独立进行复制的单位。基因组中能独立进行复制的单位。 每个复制子都含有控制每个复制子都含有控制 复制起始的复制起始的起点起点。 n n 复制叉复制叉 复制泡或复制眼复制泡或复制眼 (2 2)方向方向 DNADNA复制可以朝一个方向,也可以朝两个方向复制可以朝一个方向,也可以朝两个方向 进行。进行。 n

9、n 双向复制双向复制 n n 滚环复制滚环复制 n n DD环复制环复制 (3 3)速度)速度 原核生物:单起点,复制叉移动的速度约为原核生物:单起点,复制叉移动的速度约为 1010 5 5 bp/minbp/min。 复制的速度取决于起始频率。复制的速度取决于起始频率。 一轮复制尚未完成,起点又开始了第二轮复制。一轮复制尚未完成,起点又开始了第二轮复制。 大肠杆菌染色体大肠杆菌染色体DNADNA复制一代需复制一代需40min40min。 真核生物:复制叉移动的速度为真核生物:复制叉移动的速度为 510510 2 2 510510 3 3 bp/minbp/min。 多个复制起点。多个复制起点

10、。 果蝇胚胎果蝇胚胎DNADNA在在3min3min内可增加一倍。内可增加一倍。 3 3 原核细胞原核细胞DNADNA的复制的复制 (DNADNA指导下的指导下的DNADNA的合成)的合成) (1 1)参与复制的酶和蛋白质)参与复制的酶和蛋白质 大肠杆菌大肠杆菌 参与复制的有参与复制的有2020多个因子:酶、底多个因子:酶、底 物、物、模板、引物模板、引物和能量。和能量。 DNADNA聚合酶聚合酶 参与复制的其他因子。参与复制的其他因子。 DNA DNA聚合酶聚合酶 催化催化4 4种脱氧核苷酸的聚合反应种脱氧核苷酸的聚合反应 DNADNA聚合酶的特点:聚合酶的特点: 以以4 4种种dNTPdN

11、TP为底物为底物 受模板的指导受模板的指导 需引物需引物3 3 -OH -OH存在存在 DNADNA链的生长方向为链的生长方向为5 5 3 3 产物产物DNADNA的性质与模板相同的性质与模板相同 大肠杆菌的大肠杆菌的DNADNA聚合酶有三种:聚合酶有三种: 活性:表活性:表13-113-1 DNA DNA聚合酶聚合酶(DNA pol DNA pol ):校对):校对 DNADNA聚合酶聚合酶(DNA pol DNA pol ):修复):修复 DNADNA聚合酶聚合酶 (DNA pol DNA pol ):复制):复制 DNADNA聚合酶聚合酶(DNA polDNA pol) DNADNA聚合

12、酶聚合酶(DNA polDNA pol) 参与复制的其他因子参与复制的其他因子 解旋酶解旋酶 拓扑异构酶拓扑异构酶 单链结合蛋白单链结合蛋白 引物酶引物酶 DNADNA连接酶连接酶 FtI8/FtI8/ (2)(2)原核细胞原核细胞DNADNA复制的过程复制的过程 DNADNA解链解链 起始起始 引物合成引物合成 延伸延伸 DNADNA链延伸链延伸 切除引物、填补缺口、连接相临的切除引物、填补缺口、连接相临的DNADNA片段片段 切除和修复错配碱基切除和修复错配碱基 终止终止 起始起始 引物引物 DNADNA聚合酶不能发动新链的合成聚合酶不能发动新链的合成, ,只能催化已有链的延只能催化已有链

13、的延 长。长。DNADNA的合成需要引物,引物为的合成需要引物,引物为RNARNA。引物的合成不需。引物的合成不需 要引物。要引物。 在在DNADNA模板链的一定部位,由引物合成酶催化,按模板链的一定部位,由引物合成酶催化,按 5353的方向合成与的方向合成与DNADNA互补的引物。互补的引物。 DNADNA聚合酶聚合酶在引物在引物RNARNA的的3OH3OH上逐个加上与模板链上逐个加上与模板链 互补的脱氧核苷酸。互补的脱氧核苷酸。 延伸延伸 冈崎片段冈崎片段 DNADNA的两条链是反向平行的。的两条链是反向平行的。DNADNA聚合酶的聚合聚合酶的聚合 方向是方向是5 35 3。因此存在矛盾。因此存在矛盾。 半不连续复制半不连续复制 : 一条链按一条链按5 35 3方向连续合成方向连续合成 前导链前导链 另一条链的合成不连续另一条链的合成不连续, ,先按先按5 35 3方向合成若干短方向合成若干短 的冈崎片段的冈崎片段, ,再连接成一条完整的再连接成一条完整的DNADNA链链 后随链后随链 3 3 复制叉移动的方向复制叉移动的方向

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