化学绘图软件ChemDraw使用简介综述

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1、化学绘图软件ChemDraw使用简介 ChemDraw Ultra 11.0版 王晓玲 图书馆信息服务部 *1 *2 ChemBioOffice 2008 *3 Content 1 2 3 *4 1 ChemDraw 简介 理念:“化学家能懂的,ChemDraw也应该懂” *5 ChemDraw 11.0工作界面 标题栏 菜单栏 工具栏 图形工具箱 编辑/绘图区 状态栏 *6 l ChemDraw 11.0可同时打开多个操作窗口 l ChemDraw 11.0菜单栏中包含了许多不同命令 *7 l中的工具栏包括主工具栏和文本工具栏 *8 工具栏 文本工具栏 l ChemDraw 11.0图形工具

2、箱 *9 选择工具 结构透视质谱碎片 化学键 橡皮擦 文本编辑 钢笔 箭头 轨道 绘图元素 基元 化学符号 质询工具 高级工具 模版 基本环系 长链 交替基团 lChemDraw 11.0图形工具箱模板中包含较多复杂分子和玻璃仪器模板 *10 氨基酸(Amino Acids) *11 芳香族(Aromatics) 双环(Bicycle) *12 玻璃仪器(Clipware) *13 构象异构(Conformers) 环戊二烯(Cp Rings) *14 环烷(Cycloalkans) DNA *15 官能团 (Functional Groups) 己醣(Hexoses) *16 纳米管(Nan

3、otubes) 苯环(Ph Rings) *17 多肽(Polypeptides) 多面体(Polyhedra) *18 RNA 立体中心 (Stereocenters) *19 超分子( Supermolecules) *20 2 利用ChemDraw 绘图绘图 2.1 绘制普通结构式 尼古丁 Nicotine Oxidation *21 利用模板绘 制共轭苯环 打开软件 添加实键 添加环戊烷 添加双键和实键 标记原子 整理结构 *22 练习题:绘制阿司匹林的化学结构 2.2 绘制反应中间体 绘制中间结构式 在线演示 选择工具标记电子移动方向 或 *25 2.3绘制复杂环结构 3,7-dim

4、ethyloct-6-ena化学结构式 通过环工具和橡皮擦来完成 选择环己烷; 并添加第一个环 添加第二个环 绘制复杂环 橡皮擦去多余部分 在相应原子位置标记原子 2.4 绘制Fischer投影式 选择键工具;连续单击生成五连键 1、绘制连续的直线 2、添加侧键 建立与五连键垂直的水平键 3、标记原子 在原子上定位建立标记 *33 2.5 绘制透视图 直接利用模板或者是手动绘制 *34 1、图形的旋转 选择 顺时针旋转环己烷30 针旋后 *35 2、添加实键 绘制时按住键,使用实键工具 绘制任意长度的键 *36 3、图形的变换 按住鼠标左键并向上拖动至原结构的50% *37 4、标记原子 选择

5、黑体楔键 单击下部两侧键的中央 5、完成透视图 选择黑体键 单击底键的中央 2.6 绘制Newman投影式 选择键工具; 连续单击生成三键对称结构 右键复制 1、绘制两个三键结构,并连接 选择键工具;按住Alt键,连接两个结构 部分选择 上面分结构 右上脚双击旋转柄,对话框中输60 单击旋转 2、旋转结构式 选择轨道工具 定位中心原子;按住Alt键, 按下鼠标键,向外按动建立轨道 3、添加空轨道 右键选择Bring to Front命令 4、调整结构及完成投影式 后面结构移至前面添加阴影框 *44 2.7绘制立体化学结构式 绘制一般结构式 添加楔键和手性碳原子标记 *45 2.8 绘制生物分子

6、 *46 模板中的DNA及RNA模板 *47 2.9 绘制简单的实验装置 真空蒸馏装置 利用玻璃仪器模板中的仪器组合搭建实验装置,如: *48 2.10 绘制反应式 *49 1、绘制反应物结构式 2、绘制生成物结构式 3、添加箭头 4、输入反应条件 5、输入物质结构名称 选择点位拖动 定位 单击 单击 定位 单击生成双键 拖动生成双键 绘制反应物 双击生成文本框并输入元素符号 定位 单击生成一单键 再定位 连续单击生成三单键 定位双击后输入OH 绘制生成物 复制 绘制箭头 选择反应箭头 在两个分子中单击 生成一反应箭头 输入反应条件 箭头上方建立文本框 输入反应条件 选择电荷 添加负电荷 输入

7、物质结构名称 依次输入文本信息 选择阴影框 将反应方程式全部罩上 在线演示 *56 3 ChemDraw 扩扩展功能 3.1 显示分析信息 对于一个已经绘制好的化学结构,可通过运用“Analysis”工具获得该结 构的化学式、分子量、相对原子质量、m/e值和各原子的百分含量等。 *57 *58 3.2 显示物理性质 ChemDraw可以计算并预测一得化学结构的物理和热力学性质。 *59 3.3 显示元素周期表 *60 3.4 预测NMR谱 1H-NMR预测 13C-NMR预测 *61 3.5 结构式和命名互相转换 1、由结构式给出IUPAC标准命名 或 *62 2、由IUPAC标准命名给出结构式 *63 ChemDraw对一些输入错误具有自动矫错功能 *64 3.6 ChemDraw与word及Chem3D关联 1、ChemDraw与word关联 或 双击结构式 *65 2、ChemDraw与Chem3D关联 *66 *67 参考书: ChemOffice 2008实用教程 曾炜, 孙延辉, 李红霞编著

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