《某些染料、药物小分子与蛋白质的相互作用研究》由会员分享，可在线阅读，更多相关《某些染料、药物小分子与蛋白质的相互作用研究（121页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、兰州大学博士学位论文某些染料、药物小分子与蛋白质的相互作用研究姓名：岳园园申请学位级别：博士专业：化学分析化学指导教师：陈兴国20100501岳园园兰州大学博士学位论文2010摘要血清白蛋白是循环体系的运输蛋白，由于能和配体相结合，经常被作为体外研究小分子与蛋白质相互作用的模型蛋白。人血清白蛋白是人体血浆中主要的一类蛋白质，充当着运输和储存内源及外源分子的作用。在实际研究中，人血清白蛋白常被作为模型蛋白来研究蛋白质折叠和与小分子的相互作用。大多数情况下，小分子与蛋白质结合能力的大小明显影响小分子表面分布容积。考虑Nd分子与蛋白质相互作用在临床和药理学的应用，本学位论文利用分子对接技术和荧光光谱
2、、紫外光谱、红外光谱、圆二色谱研究了某些染料、除草剂、药物小分子与人血清白蛋白的相互作用；通过荧光共振能量转移确定了人血清白蛋白分子中色氨酸残基214与受体之间的距离；考察了共存物质对这些小分子与人血清白蛋白结合常数的影响。本论文分为五章：第一章：简要介绍了能与蛋白质相互作用的小分子类别，蛋白质的分类、结构及功能，介绍了常用研究小分子与蛋白质相互作用的方法。第二章：利用荧光、紫外、红外、圆二色谱等光谱法和分子对接研究了草甘膦与人血清白蛋白的作用机理。考察了人血清白蛋白与草甘膦相互作用的结构特征。在不同温度下测定了两者的结合常数，通过VantHoff方程确定二者相互作用的熵变和焓变。结果表明草甘
3、膦和人血清白蛋白之间主要通过疏水作用力和氢键结合。通过F0rster非辐射能量转移方法计算了二者的距离。通过紫外、红外、圆二色谱证明了草甘膦对人血清白蛋构象的影响。第三章：使用光谱和分子对接方法研究了达旦黄、萘酚绿B两种染料分别与人血清白蛋白的相互作用，考察了共存物质对达旦黄萘酚绿B一人血清白蛋白结合常数的影响。光谱分析结果表明这两种染料通过静态猝灭与人血清白蛋白发生相互作用，导致蛋白质的二级结构发生了改变。通过实验测定的结合常数、结合位点数、基本的热力学参数确定了这两种染料与人血清白蛋白荧光的键合模式。第四章：通过光谱法和分子模拟方法研究了川陈皮素、秦皮乙素、杜果素分别与人血清白蛋白的相互作
4、用。结果表明这三种中药活性组分与人血清白蛋白之间形成复合物。疏水作用在结合过程中起主导作用。通过同步荧光、红外、紫外摘要吸收、圆二色谱证明这三种活性组分与人血清白蛋白的相互作用会对蛋白质构象产生影响。共存物质会对秦皮乙素丰亡果素与人血清白蛋白的结合常数产生影响。分子对接结果从分子水平上对这三种活性物质与蛋白质的结合位点进行了证实。第五章：在生理条件下利用荧光、紫外吸收、红外、圆二色谱等光谱法和分子对接方法考察了奥沙利铂与人血清白蛋白的相互作用。结果表明奥沙利铂猝灭人血清白蛋白荧光的机理为静态猝灭。圆二色谱、红外光谱分析结果表明奥沙利铂和人血清白蛋白的作用导致蛋白质构象的变化。分子对接结果表明奥
5、沙利铂与人血清白蛋白残基的结合部位位于人血清白蛋白IIA区。人血清白蛋白一奥沙利铂的结合常数受金属离子和氨基酸等共存物质的影响。岳园园兰姆大学博士学位论文2010AbstractSerumalbuminbeingthemajorligandbmdmgandtransportproteinofcirculatorysystemisconsidered嬲amodelproteinforstudyingsmallmoleculesproteininteractioninvitroHumanserumalbumin(HSA)，themainproteininthebloodplasmaactingas
6、thetransporteranddispositionofendogenousandexogenouscompounds，hasbeenfrequentlyusedasamodelproteinforinvestigatingtheproteinfoldingandligand-bindingmechanismInmostcases，smallmoleculesinteractionsatproteinbindinglevelwillsignificantlyaffecttheapparentdistributionvolumeofthesmallmoleculesConsideringth
7、eapplicationofsmallmolecules-proteininteractionsindiagnosticandpharmaceutical，thebindingdmracteristicsofhumanserumalbuminwithdyes，herbicideanddrugswerestudiedbyemployingfluorescence，ultraviolet-visible(oV-、，is)，FouriertransinfraredfiT-m)，andcirculardichroism(CD)Thebindingaveragedistancebetweenthedon
8、or0直SA)andtheacccptorwasuatedaccordingtotheFSsterStheoryofnon-radiationenergytransfer；theeffectsofcoexistentsubstancesonthebindingconstantsofsmallmoleculesHSAcomplexwerealsodiscussedThisthesisisdividedintofivechapters：Chapter1：ManysmallmoleculeswhichcaninteractwithproteinwerepresentedThetypes，struct
9、ures，functionsofproteinswercintroducedThesforthestudyoftheinteractionbetweensmallmoleculesandproteinswerereviewedChapter2：Theinteractionmechanismofherbicideglyphosateandhumanserumalbuminhasbeencharacterizedbyfluorescence，UV，FT一乙CDspectroscopicandmolecularmodelingsThestructuralcharacteristicsofHSAand
10、glyphosatewerestudied，andaffmityconstantsweredeterminedunderdifferenttemperaturesTheenthalpychangesandtheentropychangeswerecalculatedaccordingtotheVantHoffequationTheseresultsindicatedthatglyphosatebindstoHSAmainlybyhydrogenbondandhydrophobicinteractioncallalsonotbeexcludedTheaveragebindingdistance，
11、rbetweenthedonor(HSA)andtheacceptor(glyphosate)wasuatedaccordingtotheF6rsterStheoryofnon-radiationenergytransferThealterationofproteinsecondarystructureinthepresenceofglyphosatewasconfirmedbytheevidencesofUV，FT-IRandCDspectroscopiesChapter3：Thebindingcharacteristicsofhumanserumalbuminwi血CIDirectYell
12、ow9，CIAcidGreen1werestudiedbyemployingspectroscopyandmolecularmodeling，respectivelyCoexistingsubstancesonthebindingconstantofCIDirectYellow9CIAcidGreen1-humanserunlalbumincomplswereinvestigatedSpectroscopicanalysisshowedthatquenchingofhumanserulnalbuminbythetwodyesoperatesbyastaticquenchingmechanism
13、andthesecondarystructuresofHSAwerechangedThebindingmodeWasinvestigatedintermsoftheassociationconstants，numberofbindingsitesandbasicthermodynamicparametersChapter4：TheinteractionsbetweennobiletinesculetinmangiferinandhumanserumalbuminwereinvestigatedbyspectroscopyandmolecularmodelingTheresultsprovedt
14、heationofcomplexbetweenthethreeactivecomponentsofChineseherbsdrugsandHSAHydrophobicinteractiondominatedintheassociationreactionThebindingofthethreeactivecomponentstoHSAleadedtochangesintheconationofHSAaccordingtosynchronousfluorescencespectraFT-IRUV-visandCDdataThepresenceofcoexistingsubstancesaffec
15、tedthebindingconstantofesculetinmangiferin-HSAcomplexComputationalmappingofthepossiblebindingsitesofthethreedrugswerealsoinvestigatedChapter5：ThisstudywasdesignedtoexaminetheinteractionofoxaliplatinwithhumansertlmalbuminunderphysiologicalconditionsbYusingfluorescence，UV-vis，FT-IRandCDspectroscopicte
16、chniquesincombinationwithmoleculardockingThequenchingmechanismofoxaliplatinwithHSAWassmilequenchingFromtheCDandFTIRresults，itwasapparentthattheinteractionofoxaliplatin谢如HSAcausedaconationalchangeoftheproteinTheresultofmoleculardockingshowedthatoxaliplatinbindtoresidueslocatedinsubdomainRAofHSAThebindingconstantofHSA-oxaliplatincomplexWasaffectedbymetalionsandaminoacids原创性声明本人郑重声明：本人所呈交的学位论文，是在导师的指导下独立进行研究所取得的成果。学位论文中凡引用他人已经发表或未发表的成果、数据、观点等，均已明确注明出
