简便快速的PCR技术

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1、简便快速的PCR技术,依赖核酸序列的扩增技术(Nucleic Acid Sequence-Based Amplification;NASBA),反应体系: 缓冲溶液 AMV逆转录酶 T7 RNA聚合酶 RNase H 引物(下游引物5端带有T7RNA聚合酶启动子序列)。,依赖核酸序列的扩增技术(Nucleic Acid Sequence-Based Amplification;NASBA),原理:靶RNA经AMV逆转录,形成RNA:DNA杂交体RNase H降解杂交体的RNA,剩下单链DNAAMV以其为模板,合成含T7RNA聚合酶启动子的双链DNAT7RNA聚合酶以其不断转录出靶RNA进入新一

2、轮扩增循环产物主要为反义单链RNA、RNA:DNA杂交体和双链DNA。,依赖核酸序列的扩增技术(Nucleic Acid Sequence-Based Amplification;NASBA),特点:可直接扩增特异性单链RNA整个反应不需PCR仪,无需温度循环,没有高温变性步骤,不会受到外来双链DNA的污染。反应速度快,忠实性好,特异性强,敏感性高。加入变性步骤, 也能扩增双链DNA。,环介导等温扩增技术(loop一mediated isothermal amplification,LAMP),反应体系:缓冲液具有链置换特性的DNA聚合酶dNTP模板DNA能够识别靶DNA 6个特异序列的4条引

3、物。引物为2条内引物和2条外引物,环介导等温扩增技术(loop一mediated isothermal amplification,LAMP),哑铃状模板合成阶段,引物FIP首先和F2c结合启动互补链的合成,形成双链结构(图1b)。F3再和F3c结合,启动链置换反应,释放出1条FIP连接的互补链,在其一端能够形成环状结构(图1d)。这条单链DNA,又可作为模板,在另一端分别结合BIP和B3,合成1条双链,并置换出1条哑铃状的DNA(图1f)。哑铃结构很快与其一端F1c和F1互补,而由自我引物延伸机制合成1种双链的茎环结构DNA(图1g)。这种茎环结构的双链DNA是循环反应的原料。,循环反应阶段

4、,FIP和双链茎环结构DNA(图Ig)中的环状结构结合,形成1种有缺口的过渡性茎环结构DNA,该结构在茎上含有靶序列的1个额外反向复制序列,在对面的末端,通过BIP形成1个环状结构。在随后的自我引物置换延伸合成过程中,在内引物作用下,开始循环反应,茎的长度和环的个数都逐渐增加,最后的产物为茎环DNA组成的混合物,即含有若干倍茎长度茎环结构和类似花椰菜的结构(含有在同一链上由退火形成的,在靶序列的交替反向重复序列之间的多重环状结构)。,环介导等温扩增技术(loop一mediated isothermal amplification,LAMP),扩增结果判定:有3 种判定方法1、琼脂糖电泳后,用E

5、B或SYBR Green I 染色检测。2、产物中加入M g + 试剂,肉眼观测副产物焦磷酸镁沉淀:阳性-液体浑浊, 静置有白色沉淀。3、产物中加SYBR Green , 肉眼观察颜色反应: 绿色阳性, 橙红色阴性。,优点,灵敏度高 能检测到比PCR低10倍的拷贝数。用3一5个细胞样本就可进行动物胚胎性别鉴定。特异性强 LAMP引物需与靶序列上的6个特异部位准确结合,因此能获得比PCR更高的特异性。速度快 LAMP是恒温扩增反应,没有PCR反应中温度变化的耗时,在30-60min内即可完成反应过程。另外,增加环引物还可缩短时间,大大提高了检测的效率。设备简单 LAMP反应只需一个简单的恒温器。产物检测便捷 LAMP反应时产生大量的焦磷酸根离子,能与镁离子结合生成白色的焦磷酸镁沉淀,可根据反应休系中是否形成白色沉淀来定性判断。,

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