1四川骨髓库汉族人群hlaa02等位基因分布2脐带源间充质干细胞分离培养及自发成骨分化现象观察

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1、硕士学位论文 学校代码:1 0 0 2 3 学号:s 2 0 0 7 4 6 3 第一部分四川骨髓库汉族人群H L A A 冰0 2 等位基因分布 第二部分脐带源间充质干细胞分离培养及 自发成骨分化现象观察 所院 : 姓名: 指导教师: 导师小组: 学科专业: 研究方向: 完成日期: 输血研究所 郑纯兴 陈强研究员 陈强陈静娴郑忠伟 免疫学 H L A 与造血干细胞移植 2 0 1 0 5 1 2 - - 一 I f 中国医学科学院& 北京协和医学院 硕士论文 目录 第一部分四川骨髓库汉族人群H L A - A 0 2 等位基因分布 中文摘要1 英文摘要3 前言。5 实验材料与方法7 结果1

2、4 讨论。2 0 结 论。2 4 参考文献。2 5 第二部分脐带源间充质干细胞分离培养及自发成骨分化现象观察 中文摘要2 7 英文摘要2 9 前言3 1 日【吞。”j 上 实验材料与方法3 3 结果4 0 讨论。4 8 结论。5 2 参考文献5 3 中国医学科学院北京协和医学院硕士论文 第三部分 综述5 5 发表文献6 4 致谢。6 5 I I l I | 0 | l l I I l l l l | l | l I | l l l l I I l I I I 北京协和医学院硕士学位论文! Y 17 7 5 6 61 四川骨髓库汉族人群H L A A 呋0 2 等位基因分布 硕士研究生郑纯兴 导

3、师陈强研究员 中文摘要 目的: 研究中国造血干细胞捐献者资料库( C M D P ) 四川分库中四川籍汉族人群 H L A A 木0 2 等位基因分布,分析H L A A 和H L A B 、D R B l 的3 座位单体型,初 步评估H L A 型别中低分辨率匹配的供患者等位基因错配的可能,为H L A A 瘩0 2 患者在四川骨髓库寻找合适的供者提供一定的选择依据。 方法: 在中华骨髓库四川分库8 9 3 4 名四川汉族造血干细胞志愿者4 5 0 8 份 H L A A 木0 2 阳性样本中随机筛选1 1 0 份,这些样本已经通过序列特异性引物聚 合酶链反应( P C R S S P )

4、或序列特异性探针( P C R S S O ) 方法获得了的中低分辨率 分型数据,采用聚合酶链式反应测序分型( P C R S B T ) 技术对H L A A 木0 2 等位 基因进行测序分析:首先通过组特异性引物,扩增出各样本的A 木0 2 等位基因序 列,进行第2 、3 、4 外显子测序,获得等位基因型别。用f 检验比较四川库汉 族与北京、香港、台湾、日本、韩国、以及美国亚太裔人群A 唪0 2 等位基因分布 的差异,并分析各人群等位基因的累积频率分布情况。采用最大似然法计算 H L A A 枣0 2 、一B 和D R B l 的3 座位单体型频率。 结果: 共检测到5 种A 奉0 2 等

5、位基因,A 木0 2 0 7 ( 4 9 5 9 ) 是优势等位基因,其余依 北京协和医学院硕士学位论文 次是A 宰0 2 0 1 0 1 ( 2 5 6 2 ) ,A 簟0 2 0 3 0 1 ( 1 9 0 1 ) ,A 掌0 2 0 6 0 1 ( 4 9 6 ) ,A 宰0 2 0 5 ( 0 8 3 ) 。同其它6 个亚裔人群的相比,四川库汉族人群的H L A A 木0 2 等位基 因分布与台湾人群的差异无统计学意义( p = 0 1 8 3 ) ,而与香港,北京,美国亚太 裔,日本,韩国等人群的差异均有统计学意义( O 0 1 ) 。 H L A A 木0 2 0 7 B 木4 6

6、 一D I 氇1 幸0 9 是四川库汉族人群最常见的单体型。四川人群的 H L A A 宰0 2 等位基因分布的集中度仅次于日本和韩国,在中国人群中偏高。四川 骨髓库库汉族人群H L A - A 幸0 2 、B 和D I m l 的3 座位单倍型频率大于0 1 的有 1 1 种,其中H U 卜A 木0 2 0 7 - B 牛4 6 D R B l 木0 9 单体型频率大于1 0 ,为优势单体型。 与A 木0 2 0 6 相关的单体型有5 种,但频率均在O 1 以下。 结论: 四川骨髓库汉族人群H L A A 木0 2 等位基因的分布符合南方汉族人群的分布 特点,与其他中国人群相比,多态性较低,

7、分布更为集中。单体型为 H L A - A 宰0 2 0 7 一B 宰4 6 D R B l 宰0 9 的患者在四川分库找到供者的机会较大。 关键字: H L A A 奉0 2 ;等位基因;单体型 2 北京协和医学院硕士学位论文 H L A - A 呋0 2d i V e r s i 锣 i nS i c h u a nH a n p o p u l a t i o ni nC M D P P o s t 鳓a t e S u p e r v i s o r Z l l e I l gC h u m 【i n g C h 朗Q i a n g A B S T R A C T o b j e c

8、 位y e : T bi n v e s t i g a t et l l ea l l e l ed i s 倒b l l t j o no fH L A A 宰0 2g e l l ef a m i l yi nS i c h u 强H a I l p o p u l a t i o ni nC h i n e s eM 锄0 wD o n o rP r 0 笋跚( C M D P ) S i c h u 锄b r a n c l l ,趾d 趾a l y Z e t l l eH L A A ,- B ,- D I m1 弱s o c i a t e dh 印l o t y p ed i

9、 V e r s i 够i nS i c h u 距H 锄p o p u l a t i o n ;T b e s t i I n a t em ep r o b a b i l i 够o fd i S p 撕够a ta 1 1 e l e1 e v e li n p a t i e n t d o n o rp a i r Sw i t h 1 0 w - r e s o l 而o nm a t c h ;T op r o V i d ed a t af o rt h eH L A - A 幸0 2 - p o s i t i V ep a t i t st os e a r c h f o

10、 rs u j t a b 】ed o D o r Si nC M D PS j c h u 卸b r a n c h M e t h o d s : At o t a lo f110s a m p l e sw e r e 啪d o m l ys e l e c t e dj 6 r o m4 5 0 8H L A 木0 2 - p o s i t i V e s 锄p l e si n8 9 3 4S i c h u 锄H a ni n d i V i d u a l sr e g i s t 部e d 、杭mm eC M D P T h e s eh a db e e I l t ) ,

11、p e da tl o wr e s 0 1 u t i o n 矗wH L A A ,一B ,- D R B 1 b yP C R - s e q u e n c es p e c i 丘cp 血n e r s ( P C R S S P ) 锄dP C R s e q u 锄c es p e c i 丘co l i 9 0 n u c l e o t i d e ( P C R S S O ) H L A - A 木0 2 a l l e l e sw e r ei d e r l 廿f i e db y P C R - s e q u e n c eb a S e d t ) ,p i

12、n g A 木0 2a 1 1 e l e sw e r ea l I l p l i f i o di n e a c hs 锄p l et h r o u 曲g r o u p s p e c i 丘ca m p l i f i c a t i o n H L A Aa l l e l e sw e r ci d e n t i f i e db y s e q u e n C i n ge X o n s2 ,3a n d4 C h i s q u a r et e s tw a sa p p l i c d t oc o n :l p a r et h ed i 扫f 醯饥c 鼯 o

13、fA 枣0 2a l l e l ed i s t r i b 矾o n sb e 咐e 吼S i c h u a nH 趾a n do 也e rA s i a np o p u l a t i o n si n B e i j i n g ,H o n gK o n 岛1 缸w 趾,J 印觚,S o u t l lK D r e aa n dA s i a nA m 舐c a n s C 啪u l a t i V e a 1 1 e l e 丘e q u e I l c yd i 矧b u t i o nw a Sa n a l y Z e d T h e 仔e q u e n c i e so f h 印l o t y p e si nH L A A , Ba I l d 加I 己B11 0 c u sw e r ec a l c u l a t e du s i n gm a x i m l 】m l i k e l i l l o o dm e m o d 3 北京协和医学院硕士学位论文 I t e s u l t s : F i v ed i 舒舢tH

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