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1、常用的生物信息学 分析方法,第十组,生物信息学是一门在生命科学的研究中,以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。,生物信息学Bioinformatics,生物信息学基本上是分子生物学与信息技术的结合体。 研究材料和结果是各种各样的生物学数据 研究工具是计算机 研究方法包括对生物学数据的搜索(收集和筛选)、处理(编辑、整理、管理和显示)及利用(计算、模拟),节律基因Timeless,数据库 MGI,http:/www.informatics.jax.org/,数据库 NCBI,https:/blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi,数据库 TAIR,http:
2、/www.arabidopsis.org/,多序列比对 MEGA,系统发育树 MEGA,http:/meme-suite.org/tools/meme,保守基序分析 MEME,基因结构 GSDS,http:/bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/,启动子分析 PlantCARE,转录因子结合位点分析 JASPAR,http:/bar.utoronto.ca/,可视化基因组学 BAR,http:/suba.live,亚细胞定位 SUBA,http:/www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre/,三级结构预测 Phyre,http:/www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/,信号肽预测 SignalP,AT5G52910,AT1G01070,http:/www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/,跨膜结构域预测 TMHMM,http:/string.embl.de,蛋白互作网络 STRING,谢谢,