碘化钾法提取dna概要

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1、基因组DNA的分离和纯化,一、实验目的,1、掌握利用碘化钾法提取外周血细胞DNA的方法 2、学会使用低温高速离心机、漩涡振荡器、核酸/蛋白质定量紫外分光光度计。,二、实验原理,1.碘化钾法提取DNA的原理:利用氯化铵形成的低渗环境破坏红细胞,后经碘化钾短时间破坏白细胞及其核膜,再通过氯仿/异戊醇等蛋白变性剂沉淀蛋白质、脂质及残存细胞碎片,最后异丙醇沉淀基因组DNA,乙醇洗涤并除去异丙醇,提取的基因组DNA用TE溶解。,2.DNA纯度的鉴定原理:由于核酸中的碱基都具有共轭双键,因此具有紫外光吸收性质,核酸在紫外光谱区有一条典型的吸收曲线,其吸收高峰在260nm处,吸收低谷在230nm处。蛋白质在

2、紫外区的吸收高峰在280nm处。因此核酸的紫外吸收光谱数据是鉴定核酸的重要依据之一。,三、实验器材与试剂,仪器:低温高速离心机、漩涡振荡器、核酸/蛋白质定量紫外分光光度计、移液枪(100ul,200ul,1000ul) 试剂:0.9%NH4Cl 、PH8.0的TE缓冲液 、生理盐水、氯仿、异戊醇、异丙醇,无水乙醇,5mol/L碘化钾。,四、实验步骤,(一)DNA的提取 1、取EDTA-K2抗凝血300L加入到1.5 mL Ep管中,加1ml0.9%NH4Cl,充分混匀后静置5分钟,待液体至变清亮后,以12000r/min的转速低温(4)离心5 min,弃上清,留沉淀。 2、加5 mol/L K

3、I溶液70L于Ep管中,于漩涡振荡器上混匀30s-1min,让沉淀充分混匀。,4、加入300L 的0.9%NaCl溶液,混匀 5、加入450L氯仿/异戊醇( 24:1,v/v)混合液,振荡混匀1-2min 。 6、12000r/min低温(4oC)离心5 min,吸取水相层,转移到新的Ep管中; 7、加入180L异丙醇于Ep管中,轻轻混匀,12000r/min低温(4oC)离心5 min,,8、弃上清,加无水乙醇1.0 mL,放置5-10min,12000 r/min低温(4oC)离心5 min,弃去无水乙醇,待干燥。 9、加入25LPH8.0的TE缓冲液溶解DNA。,五、实验结果观察,1、吸

4、取5ulDNA样品,加PH8.0的TE缓冲液至100ul,混匀后,装入紫外分光光度计的一次性比色杯中。 2、用100ul的PH8.0的TE缓冲液为空白管调零。 3、读取仪器显示的A260与A260/A280两个值,4、DNA浓度=A260x20x50/1000(ug/ul) ; DNA纯度=A260/A280。 5、数据显示,A260/A280的比值为1.8是高纯度的DNA的标志,一般临床上取A260/A280比值在1.8-2.0之间。若低于1.8则表示有蛋白质(芳香族)或者酚类物质污染,需要纯化样品,如果比值偏高,高于2.0表示有RNA污染。 。,六、注意事项,1.实验过程中每一步都要小心温和的操作,避免剧烈的吸取、震荡、混匀 2.由于试剂有毒、腐蚀性,为避免实验过程中引起灼伤,操作时必须戴手套、防护镜及防护衣,七、思考题,1,DNA的提取和纯化,最后测定DNA纯度的时候,为什么取A260/A280的比值?,

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