WesternBlot实验步骤自己总结资料

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1、 Western Blot 步骤步骤 北京协和医学院 阜外心血管病医院 心外科 心血管病国家重点实验室 北京协和医学院 阜外心血管病医院 心外科 心血管病国家重点实验室 吴益和吴益和 一心肌总蛋白提取(一)一心肌总蛋白提取(一) TRIzol Reagent 蛋白质的提取蛋白质的提取 1. 准备试剂:1. 准备试剂:异丙醇;含0.3M 盐酸胍的95%乙醇; 无水乙醇; 1%SDS。 1. 含0.3M 盐酸胍的95%乙醇: 盐酸胍(分子量95.53) :95%乙醇=14.3295g:500ml 21%SDS: SDS:H2O=0.5g:50ml 2. 操作步骤: 2. 操作步骤: 1. 取沉淀

2、DNA 后剩余的上清,用异丙醇沉淀蛋白质。每使用1ml TRIzol 加 1.5ml 异丙醇,室温放置10分钟,2812000g 离心10分钟弃上清; 2. 准备0.3M 盐酸胍(guanidine hydrochloride)的95%乙醇洗涤液; 3. 用含0.3M 盐酸胍(guanidine hydrochloride)的95%乙醇洗涤蛋白质沉淀。 每使用1ml TRIzol 加2ml 洗涤液,室温放置20分钟(Note:(Note: .蛋白质沉淀可蛋白质沉淀可 保 存 在 含保 存 在 含 0.3M 盐 酸 胍 的盐 酸 胍 的 95%乙 醇 中乙 醇 中 2 8 一 个 月 以 上 或

3、 一 个 月 以 上 或 -20 一 年 以 一 年 以 上)上) ; 4. 287500g 离心5分钟,弃上清; 5. 重复3-4两次以上; 6. 在三次洗涤后加2ml 无水乙醇到蛋白质沉淀中,涡旋混匀15秒(Note:(Note: .蛋蛋 白质沉淀可保存在无水乙醇中白质沉淀可保存在无水乙醇中28一个月以上或一个月以上或-20一年以上)一年以上) ; ; 7. 室温下孵化20分钟; 8. 287500g 离心5分钟,弃上清; 9. 风干蛋白质沉淀5-10分钟(可以延长时间直到满意为止),不要干燥过度; 10.蛋白质重悬浮: 1)用1% SDS(十二烷基硫酸钠)溶解蛋白质(200 L),反复吸

4、打,50温浴 使其完全溶解; 2)2810000g 离心10分钟除去不溶物; 3)将包含蛋白质的上清转移到新的 EP 管中(此时分离得到的蛋白质样品可 直接用于 Western Blot(之前先测浓度)(之前先测浓度)或-20保存备用) ; 4) 因为不同溶剂中某些蛋白质的溶解性不同, SDS 溶液中蛋白质的可溶性差, 如果蛋白质沉淀在 SDS 溶液中不可溶, 那么可以选择下面的溶剂(Hummon et. al., 2007)来溶解蛋白质沉淀: 1% SDS and 62.5 mM sarkosyl(肌氨酰:裂解病毒颗粒或感染细胞的一种去污 剂) at pH 8.08.8; 9.5 M ure

5、a and 2% CHAPS, pH 9.1; 250mM glycerol(甘油), 10mM TEA, and 4% CHAPS; 2% diethylamine(二乙胺) ; 10M Urea(尿素) 。 3. 常见问题分析: 3. 常见问题分析: 1. 得率低:A.样品裂解或匀浆处理不彻底;B.最后得到的蛋白质沉淀未完全 溶解。 2. 蛋白质降解:组织取出后没有马上处理或冷冻。 3. 电泳时条带变形:蛋白质沉淀洗涤不充分。 要不直接用裂解液或 SDS 缓冲液来代替 1% SDS 溶解蛋白质 要不直接用裂解液或 SDS 缓冲液来代替 1% SDS 溶解蛋白质 采用上述方法提取的蛋白,可以

6、用 lowry 法或 BCA 法进行蛋白定量 一一心肌总蛋白提取(二) 心肌总蛋白提取(二) 裂解液法提取总蛋白 裂解液法提取总蛋白 1材料 1材料 心肌:手术室活检标本 试剂:蛋白裂解液,碧云天,产品编号 P0013 仪器:组织匀浆机,Tekmar 2方法和过程: 2方法和过程: (1) 将心肌组织块(222mm)放入含有裂解液的 1.5ml EP 管中(裂解液含量视组织量而 定) ,用微量匀浆器进行冰上迅速低温匀浆,直到看不见颗粒为止。 (如果需要测磷酸化蛋白,则在裂解液中加入磷酸酶抑制剂(普利来公司) ,具体方法 见说明书) (如果需要测磷酸化蛋白,则在裂解液中加入磷酸酶抑制剂(普利来公

7、司) ,具体方法 见说明书) (2) 将匀浆液移至 EP 管中,冰上放置 10 分钟,14000rpm/min,4,离心 15 分钟,取上 清,-80保存备用,待测浓度。 二蛋白浓度测定 二蛋白浓度测定 1材料准备:材料准备: 试剂:碧云天 BCA 蛋白浓度测定试剂盒(增强型) 产品编号 P0010 仪器:酶标仪(BIO-RAD 680) 2方法步骤(见试剂盒说明书) :方法步骤(见试剂盒说明书) : (1) 取 1.2ml 蛋白标准配制液加入到一管蛋白标准(30mg BSA)中,充分溶解后配制成 25mg/ml 的蛋白标准溶液。配制后可立即使用,也可-20长期保存; (2) 稀释标准品:取适

8、量 25mg/ml 蛋白标准,稀释至 0.5mg/ml(蛋白样品在什么溶液中,标 准品也宜用什么溶液稀释。但为了简便起见,也可以用 0.9%NaCl 或 PBS 稀释标准品)。 (蛋白样品在什么溶液中,标 准品也宜用什么溶液稀释。但为了简便起见,也可以用 0.9%NaCl 或 PBS 稀释标准品)。 稀释后的 0.5mg/ml 蛋白标准也可-20长期保存; (3) 配制 BCA 工作液:按 50 体积试剂 A 加 1 体积试剂 B 配制适量工作液,充分混匀(配 制的量视样本量而定,200l/孔) 。工作液室温 24 小时内稳定。 (4) 加标准品:将标准品按 0、1、2、4、8、12、16、2

9、0l 加入 96 孔板的标准品孔中(做 副孔) ,加标准品稀释液补足到 20l。 (5) 加样品:加 2l 样品到 96 孔板的样品孔中,加 18l PBS(最好用 1%SDS 或裂解液,保 持与原样本中的一致) (最好用 1%SDS 或裂解液,保 持与原样本中的一致),使总体积达到 20l。 (6) 加工作液:每孔加入 200l 步骤 2 所配制工作液。 (7) 37静置 20-30 分钟。可室温放置 2 小时。 (8) 酶标仪测定 A562,540-595nm 之间的波长也可接受。 (9) EXCEL 绘制标准曲线,根据标准曲线计算样品的蛋白浓度。 附:倍比稀释方法 附:倍比稀释方法 1.

10、 取 8 个 EP tubes; 2. 第 1 管加入 25l 0.5mg/ml蛋白标准品, 其余各管加入 25l ddH2O(最好用最好用 1%SDS或裂解 液,保持与样本中的一致 或裂解 液,保持与样本中的一致); 3. 向第 2 个 tube 中加 25l BSA 蛋白标准品, 混合均匀后从第 2 个 tube 中取 25l 稀释后的 BSA 到第 3 个有 25l ddH2O 的 tube 中,混合均匀;再从第 3 个 tube 中取 25l 第二次 稀释后的 BSA 到第 4 个有 25l ddH2O 的 tube 中;直到第 7 个 tube; 4. 第 8 个管为空白孔,单加dd

11、H2O(最好用最好用 1%SDS或裂解液,保持与样本中的一致或裂解液,保持与样本中的一致); 5. 如此配制出稀释了 1 倍,2 倍,4 倍,8 倍,16 倍,32 倍,64 倍,空白的蛋白标准品 溶液。 三三Western Blot 用蛋白样品制备用蛋白样品制备 1材料:材料: 5loading buffer(普利莱公司) 或 4loading buffer(Takara 公司)公司) 2方法:方法: 样品 40g 蛋白量 10-40g, 我的 20g 足已 4l(20l 体系)/6l(30l 体系)5SDS loading buffer 或 4loading buffer 5l(20l 体

12、系)/7.5l(30l 体系) 上样缓冲液中含有 DTT,不 需要再加 DTT 加 ddH2O 至总体积 20l(30l) 100,加热 5min 使蛋白变性,立即放冰中速冷,-20放置备用。 (上样总体积一般不超过 20l,加样孔的最大限度可加 30l 样品。 ) 四聚丙稀酰胺凝胶电泳四聚丙稀酰胺凝胶电泳 1. SDS 聚丙稀酰胺凝胶的配制(自制胶) 1. SDS 聚丙稀酰胺凝胶的配制(自制胶) 准备:准备:玻璃板用水冲干净,直立晾干,餐巾纸擦干净。 装上玻璃板,前后推动,最后往前拉些距离,扣上开关。 槽下面的海绵条带些水,可以部分抵抗漏水。 放装有玻璃板的架子于槽上,先放下部,再靠上部,加

13、紧。 加入水,液面稍高些,等 15 分钟,看是否漏水。然后拿整个槽将水倒掉,再用吸水 纸吸干玻璃板内的残余水份。 1)安装玻璃板 ? 玻璃板洗干净即可 ? 小玻璃板向前, 两玻璃板间夹上 spacer, 拧紧螺栓固定 (安装一定要平, 防漏水) ? 加满蒸馏水,看是否漏水,静置 15min(记录漏液体积,以胶补充) ? 用窄滤纸条吸干两玻璃板间的水滴 2)按分子量配制一定浓度的分离胶(12%,体积 10ml) ddH2O 3.3ml 30%丙烯酰胺溶液 4.0ml 1.5 mol/L Tris(PH8.8) 2.5ml 10%SDS 溶液 100l 10%过硫酸铵(AP) 100l TEMED

14、 4l ? 加 TEMED 之前,充分混匀内容物,一旦加入 TEMED,快速旋动混合物。 ? 在两玻璃板的间隙中灌胶,每板约 3.5ml,加至旁边绿色柱子的上缘(如开始有漏液 现象,则要补上漏的那部分体积) ? 在胶溶液上加满ddH2O(或加无水乙醇可以消泡)(或加无水乙醇可以消泡) ,室温 30min(可防止氧气扩散进入 凝胶而抑制聚合反应) 附:附: 标准的:SDS-聚丙烯酰胺凝胶的有效分离范围 标准的:SDS-聚丙烯酰胺凝胶的有效分离范围 丙烯酰胺浓度(%) 线性分离范围(kDa) 15 10-43 12 12-60 10 20-80 7.5 36-94 5.0 57-212 网上的:分

15、子量范围与凝胶浓度的关系网上的:分子量范围与凝胶浓度的关系 分子量范围 适用的凝胶浓度/(%) 蛋 白 质 5105 2-5 核酸(RNA) 150 kDa migrate more slowly, and require more time to transfer. If your protein of interest is in this size range, it may be necessary to use a Run Time of 810 minutes for your transfer. 3)Small proteins 80 的,建议 18V,16 分钟) (他们的:2

16、5V,30 分钟,具体需根据预实验调 整) 5. 电转 15min 后关闭装置; ? 取下硝酸纤维素膜,去离子水漂洗膜; ? 丽春红染色 510min,轻摇。 ? 蛋白带出现后,TBST 洗膜,圆珠笔标出 marker 位置。若不继续做,则冰箱保存。 六Western blotting 六Western blotting 试剂准备: 1. 10TBS 缓冲液缓冲液 1L Tris 碱 24.2g NaCl 80g 定容 1L 浓 HCl 调节 PH 到 7.6 2. 1TBST 缓冲液缓冲液 1TBS (pH 7.6) 1L Tween20 1000l 快速搅拌 34h。 3. 封闭液封闭液 脱脂奶粉

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