猪常见病pcr检测程序

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1、猪病检测手册目录猪瘟RT-PCR检测程序3猪繁殖与呼吸综合症RT-PCR检测程序5高致病性猪繁殖与呼吸综合症RT-PCR检测程序7猪流行性乙型脑炎RT-PCR检测程序9猪伪狂犬病毒(PRV)PCR检测程序11猪细小病毒(PPV)PCR检测程序13猪圆环病毒型(PCV2)PCR检测程序15细菌学检测程序17 猪瘟RT-PCR检测程序一 、病毒RNA的提取1、阳性对照RNA的提取材料 冻干猪瘟兔化弱毒疫苗、检测用病毒RNA提取试剂盒(天跟公司产品)。方法 将1瓶猪瘟兔化弱毒冻干疫苗用1.5ml蒸馏水或PBS液稀释,用1ml RNase-free管分装,每管500l,-20保存。取出冻存的猪瘟病毒,

2、解冻后离心,取上清用于RNA的提取。RNA提取按试剂盒说明进行,最后用50l RNAase-free水溶解RNA,得到RNA溶液。2、疑似病料RNA的提取样品采集 采集病死或扑杀的猪,取血清、扁桃体、淋巴结(包括肺门、腹股沟和肠系膜淋巴结)、肺脏、脾脏、肾脏、流产胎儿等组织病变与健康部交界处组织;待检活猪,用注射器取血5ml,4保存,送检(病料要新鲜,严禁反复冻融病料)。附:通常木乃伊胎不能作为检测样品。对于新鲜流产的胎儿,可作为检测样品。对于流产日龄较早的胎儿,可取整个胎儿保存;如果是晚期流产的胎儿,最好根据上述步骤,摘取相应组织,保存送检。胎儿的保存方法同上。组织样品处理 称取病变组织0.

3、5g于研磨器中研磨,加入1.5ml PBS(PH7.2)继续研磨制成1:3的组织匀浆液,转至1.5ml灭菌离心管中,8000r/min离心2min,取上清液用于RNA的提取;全血样品处理:待血凝后取血清用于RNA的提取。 RNA提取 待检样品RNA的提取按试剂盒说明进行,最后用50l RNAase-free水溶解RNA,得到RNA溶液。二、 RT-PCR反应1、材料 RT试剂盒(东洋纺产品)、PCR试剂盒(天跟公司产品)。引物序列:F:5-GACCTGGATGCGACTGACC-3 , 19bp ,TM为61.88。 R:5-GCGGCGAGTTGTTCTGTTAG-3, 20bp,TM为59

4、.85。扩增的目的片段为133bp。 2、 RT体系及反应程序:名称弱毒疫苗阳性对照检测病料RNase-Free 水6l0特异性下游引物1l1l模板RNA5l11lTotal12l12l置于PCR仪上6510min,立即冰浴5min。然后加入以下试剂:变性后的RNA溶液12l5RT buffer4ldNTP mixture2lRNase Inhibitor1lRever TraACE1lTotal20l按以下程序反转录: 1、 42,45min 2、 99, 5min将cDNA -20保存。 3、 PCR反应体系及程序ddH2O7.5lcDNA3l上游引物1l下游引物1l2Master mix

5、12.5lTotal25l反应程序: 1、94,3min2、95,30sec3、56,30sec 35cycles4、72,1min5、72,10min三、电泳 用TAE电泳缓冲液配制1.8%的琼脂糖凝胶,100ml加入5l染色液。80V/70Ma电泳40min观察结果,在阳性对照出现133bp条带、阴性对照无条带的情况下,检测样品如出现133bp的条带,判定为猪瘟病毒阳性。猪繁殖与呼吸综合症RT-PCR检测程序一 、病毒RNA的提取1、阳性对照RNA的提取材料 冻干PRRS弱毒疫苗、检测用病毒RNA提取试剂盒(天跟公司产品)。方法 将1瓶PRRS弱毒冻干疫苗用2ml生理盐水或PBS液稀释,用

6、1ml RNAase-free管分装,每管200l,-20保存。取出冻存的病毒,解冻后用于RNA的提取。RNA提取按试剂盒说明进行,最后用50l RNAase-free水溶解RNA,得到RNA溶液。2、疑似病料RNA的提取样品采集 病死或扑杀猪,取病死或扑杀猪,取血清、淋巴结(包括肺门和腹股沟淋巴结)、肺脏、脾脏、流产胎儿等病变明显部位与正常组织交替处组织(检测蓝耳病必须包括淋巴结和肺脏样本);待检活猪,用注射器取血5ml,4保存,送检(病料要新鲜,严禁反复冻融病料)。附:通常木乃伊胎不能作为检测样品。对于新鲜流产的胎儿,可作为检测样品。对于流产日龄较早的胎儿,可取整个胎儿保存;如果是晚期流产

7、的胎儿,最好根据上述步骤,摘取相应组织,保存送检。胎儿的保存方法同上。组织样品处理 称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5ml PBS(pH7.2)继续研磨制成1:3的组织匀浆液,转至1.5ml灭菌离心管中,8000r/min离心2min,取上清液用于RNA的提取;全血样品处理:待血凝后取血清用于RNA的提取。RNA提取 待检样品RNA的提取按试剂盒说明进行,最后用50l RNAase-free水溶解RNA,得到RNA溶液。二、 RT-PCR反应1、材料 RT试剂盒(日本东洋纺产品)、PCR试剂盒(天跟公司产品)。引物序列:F:5-CAACGCCAGCAACGACAG -3 , 18b

8、p,TM为59.58。 R:5-ACGGAACCATCAAGCACAAC-3, 20bp,TM为57.8。扩增的目的片段为468bp。2、RT体系及反应程序:名称弱毒疫苗阳性对照检测病料RNase-Free 水6l0特异性下游引物1l1l模板RNA5l11lTotal12l12l置于PCR仪上6510min,立即冰浴5min。然后加入以下试剂:变性后的RNA溶液12l5RT buffer4ldNTP mixture2lRNase Inhibitor1lRever TraACE1lTotal20l按以下程序反转录: 1、 42,45min 2、 99, 5min将cDNA -20保存。 3、 P

9、CR反应体系及程序ddH2O7.5lcDNA3l上游引物1l下游引物1l2Master mix12.5lTotal25l反应程序: 1、94,3min2、95,30sec3、56,30sec 35cycles4、72,1min5、72,10min三、电泳用TAE电泳缓冲液配制1.2%的琼脂糖凝胶,100ml加入5l染色液。80V/70Ma电泳50min观察结果,在阳性对照出现468bp条带,阴性对照无条带出现的情况下,检测样品如出现468bp的条带,判定为PRRS病毒阳性。 高致病性猪繁殖与呼吸综合症RT-PCR检测程序一 、病毒RNA的提取1、阳性对照RNA的提取材料 阳性对照病料为该病的活

10、疫苗、检测用病毒RNA提取试剂盒(天跟公司产品)。方法 RNA提取按试剂盒说明进行,最后用50l RNAase-free水溶解RNA,得到RNA溶液。2、疑似病料RNA的提取样品采集 病死或扑杀猪,取血清、淋巴结(包括肺门和腹股沟淋巴结)、肺脏、脾脏、流产胎儿等病变明显部位与正常组织交替处组织(检测蓝耳病必须包括淋巴结和肺脏样本);待检活猪,用注射器取血5ml,4保存,送检(病料要新鲜,严禁反复冻融病料)。附:通常木乃伊胎不能作为检测样品。对于新鲜流产的胎儿,可作为检测样品。对于流产日龄较早的胎儿,可取整个胎儿保存;如果是晚期流产的胎儿,最好根据上述步骤,摘取相应组织,保存送检。胎儿的保存方法

11、同上。组织样品处理 称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5ml PBS继续研磨,匀浆后转至1.5ml灭菌离心管中,8000r/min离心5min,取上清液用于RNA的提取;全血样品处理:待血凝后取血清用于RNA的提取。RNA提取 待检样品RNA的提取按试剂盒说明进行,最后用50l RNAase-free水溶解RNA,得到RNA溶液。二、 RT-PCR反应1、材料 RT试剂盒(日本东洋纺产品)、PCR试剂盒(天跟公司产品)。引物序列:F:5-TGATGGGCGACAATGTCC- 3 , 18bp,TM为55.56。 R:5- CGCAGGCAAATCCAGAGG-3, 18bp,TM为

12、61.11。扩增的目的片段为230bp。2、 RT体系及反应程序:名称弱毒疫苗阳性对照检测病料RNase-Free 水6l0特异性下游引物1l1l模板RNA5l11lTotal12l12l置于PCR仪上6510min,立即冰浴5min。然后加入以下试剂:变性后的RNA溶液12l5RT buffer4ldNTP mixture2lRNase Inhibitor1lRever TraACE1lTotal20l按以下程序反转录: 1、 42,45min 2、 99, 5min将cDNA -20保存。 1、 PCR反应体系及程序ddH2O7.5lcDNA3l上游引物1l下游引物1l2Master mi

13、x12.5lTotal25l反应程序:1、94,3min2、95,30sec3、52,30sec 35cycles4、72,1min5、72,10min三、电泳用TAE电泳缓冲液配制1.5%的琼脂糖凝胶,100ml加入5l染色液。80V/70Ma电泳40min观察结果,在阳性对照出现230bp条带,阴性对照无条带出现的情况下,检测样品如出现230bp的条带,判定为高致病性PRRS病毒阳性。 猪流行性乙型脑炎RT-PCR检测程序一 、病毒RNA的提取1、 阳性对照RNA的提取材料 阳性对照病料为该病的弱毒疫苗、检测用病毒RNA提取试剂盒(天跟公司产品)。方法 RNA提取按试剂盒说明进行,最后用5

14、0l RNase-free水溶解RNA,得到RNA溶液。2、疑似病料RNA的提取样品采集 采集病死或扑杀的猪,取血液、腹股沟淋巴结、脑脊髓液、死产胎儿的脑组织、分泌物、脾、肿胀的睾丸等组织病变与健康部交界处组织;待检活猪,用注射器取血5ml,4保存,送检(病料要新鲜,严禁反复冻融病料)。附:通常木乃伊胎不能作为检测样品。对于新鲜流产的胎儿,可作为检测样品。对于流产日龄较早的胎儿,可取整个胎儿保存;如果是晚期流产的胎儿,最好根据上述步骤,摘取相应组织,保存送检。胎儿的保存方法同上。组织样品处理 称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5ml生理盐水继续研磨,匀浆后-20反复冻融3次,转至1.5ml灭菌离心管中,8000r/min离心2min,取上清液用于RNA的提取;全血样品处理:待血凝后取血清用于R

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