qpcr流程图

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1、一、Total RNA的提取:1. 取出样本,放入灭过菌的研钵中,倒入液氮,研磨,整个过程要始终保持有液氮,15min左右,研磨充分后加入1.5ml的EP管,加入1ml Trizol,充分匀浆。(另一种,加入trizol会冻起来,就一直研磨,直到最后化成液体。)2. 室温静置10min,12000g,4度,5min,上清转移到新的1.5ml的EP管中3. 加入1/4体积的氯仿,振荡混匀,室温静置15min,12000g,4度,15min,上清转移至新管;4. 加入等体积的异丙醇,轻轻摇匀,室温静置10min,12000g,4度,10min5. 弃上清,留沉淀,加入1ml的75%乙醇清洗沉淀,7

2、500g,4度,5min,弃上清保留沉淀。重复三次6. 弃上清留沉淀,自然风干(510min),加入32ul DEPC处理过的水,测OD260/280的值,根据结果调整至1g/l=1000ng/l,立即进行反转录,剩余的RNA标好号存放在-80下。附:1OD260=40g/ml用样本跑电泳,确定RNA的完整性,注意在这之前把胶配好。(可无)可见明显的两条带,并且28S是18S亮度的两倍,还有下边一条不太明显的5SRNA的条带。证明RNA完整无降解。二、反转录:说明书:10 l 反应体系可最大使用 500 ng 的 Total RNA。20/1g(以前用的40,下次用20)20ul的体系:先把b

3、uffer和RNase Free dH20和enzyme 配成mix5PrimeScript Buffer( for Real Time):4lPrimeScript RT Enzyme Mix I :1lOligo dT Primer( 50 M):1lRandom 6 mers( 100 M):1l总RNA :1l(1g/l)RNase Free dH2O :12l反转录反应条件如下:37 15 min (反转录反应)85 5 sec(反转录酶的失活反应)4 -20分装保存(尽量不要反复冻融,avoid freeze-thaw cycles)三、内参检测 -actin 50l体系试剂使用量

4、10*taq buffer5ldNTP4lPrimer-F(100M)0.5lPrimer-R(100M)0.5lTaq E0.25l模板500 ng1l灭菌蒸馏水加至50lPCR 反应条件:扩增 1 kb 的 DNA 片段的 PCR 反应条件如下:预变性:95,3min98 10 sec.55 30 sec.(下次60,去掉非特异性)72 30 s(对于80bp的内参来说是不是可以省去)72 5min.4保存电泳:2%琼脂糖凝胶,125V,15min,注意换成20bp的marker,不要加太多。四、定量PCR电泳检测,条件同上。增大至50个循环。五、分析数据引物AT1F: GCCCTTCGGCAATCACCTATAT1R: TGAGACACGTGAGCAGGAACAT2F: CCTGGCAAGCATCTTATGTAGTTCAT2R: CCGGAAATAAAATGTTGGCAATACTIN FGCAGATGTGGATCAGCAAGCR GGCGGACTGTTACTGAGCT

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