实用pcr流程表

上传人:简****9 文档编号:107017397 上传时间:2019-10-17 格式:DOC 页数:8 大小:77KB
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1、临床PCR检验流程记录表 检验日期: 检验项目: HBV-DNA 扩增仪中保存文件名 使用说明:严格按单一流向进行实验,即试剂准备区标本制备区扩增区,严禁逆向移动。本记录表的流向亦遵循此流程;各项工作执行后在相应项目前的方框内打“”;本记录表最后归档保存在PCR实验室扩增区的专用文件夹中,以备查找。实验前准备试剂在有效期内 扩增仪、加样器、金属浴、温湿度计等仪器在校准有效期内(校准之日起1年) 生物安全柜的滤膜在使用有效期内 离心管、带滤芯吸头已经过质检合格 各区按消毒液配制SOP配制500mg/L含氯消毒液、2000mg/L含氯消毒液和70%酒精,即用即配。 打开通风设备操作者 试剂准备区实

2、验前:更换专用工作服、戴口罩、帽子、鞋套 实验台面清洁(500mg/L含氯消毒液、70%酒精或水擦拭) 冰箱温度:冷藏室(28) ; 冷冻室(-202) 实验室温度 (允许范围:1530);相对湿度: (允许范围:30%70%)PCR试剂来源: 试剂厂家:口 深圳匹基生物工程有限公司 批号: 检验项目: HBV-DNA 本次实验用量: 人份; 剩余量: 人份其他有关试剂配制: 仪器设备使用:离心机:正常 不正常 ; 振荡器:正常 不正常; 生物安全柜: 口 正常 口 不正常实验后: 按实验室清洁消毒SOP清洁实验室台面、地面、加样器和离心机,并进行紫外线照射30分钟以上。 按实验室废弃物处理S

3、OP处理实验废弃物。 操作者 检验日期: 检验项目: HBV-DNA 样本处理区实验前:更换专用工作服、戴口罩、帽子、鞋套 实验台面清洁(500mg/L含氯消毒液、70%酒精或水擦拭) 冰箱温度:冷藏室(28) ; 冷冻室(-202) 实验室温度 (允许范围:1530);相对湿度: (允许范围:30%70%)HBV-DNA阳性室内质控物来源: 浓度及批号: 扩增位置:HBV-DNA阴性室内质控物来源: 批号: 扩增位置:所处理的HBV-DNA标本(对应标本接收的唯一编号)及拟扩增位置:1917253341495765738189210182634425058667482903111927354

4、35159677583914122028364452606876849251321293745536169778593614223038465462707886947152331394755637179879581624324048566472808896核酸提取及加样过程:按乙型肝炎病毒DNA荧光定量PCR操作程序SOP进行。 仪器设备使用: 生物安全柜: 正常 不正常; 恒温金属浴: ;离心机: 正常 不正常; 振荡器: 正常 不正常; 低温离心机:制冷:正常 不正常; 离心:正常 不正常 实验后: 按实验室清洁消毒SOP清洁实验室台面、地面、加样器和离心机,并进行紫外线照射30分钟以上。

5、 按实验室废弃物处理SOP处理实验废弃物。 口 使用后标本冷冻保存3个月,以备复查。 操作者 检验日期: 检验项目: HBV-DNA 扩增及产物分析区实验前:更换专用工作服、戴口罩、帽子、鞋套 实验台面清洁(500mg/L含氯消毒液、70%酒精或水擦拭) 实验室温度 (允许范围:1530);相对湿度: (允许范围:30%70%)LightCycler扩增仪操作:开机自检及运行正常; 按LightCycler操作使用SOP进行编程、参数设定HBV-DNA 标准曲线计算值:Slope 值: Intercept值: r2值: 室内质控结果:阴性质控物结果: ;阳性质控物结果: 口填写室内质控记录、质

6、控图; 是否失控:口否 口是室内质控结果:阴性质控物结果: ;阳性质控物结果: 口填写室内质控记录、质控图; 是否失控:口否 口是失控原因及分析:(失控判断标准及原因分析按室内质控SOP进行)实验结果:见所附扩增仪打印结果实验结果有效性判断:有效 无效(依据实验结果有效性判断SOP进行)实验后: 按实验室清洁消毒SOP清洁实验室台面、地面、加样器和离心机,并进行紫外线照射30分钟以上。 按实验室废弃物处理SOP处理实验废弃物。 操作者 1. 操作步骤:1.2.1 取n个1.5ml的灭菌离心管,作好标记。(n=样本数+1管HCV阴性对照+1管HCV强阳性对照+1管HCV临界阳性对照)1.2.2

7、向上述离心管中分别加入25ul蛋白酶溶液。1.2.3 分别加入待测样本、HCV阴性对照、HCV临界阳性对照和HCV强阳性对照各200ul.1.2.4 加入200ul新鲜配制的裂解液工作液,盖上盖子,振荡15秒,充分混匀。(注意:不要把蛋白酶溶液直接加入裂解液工作液中)。1.2.5 56摄氏度温浴15分钟。瞬时离心,以去除管盖上的滴液。1.2.6 加入250ul无水乙醇,盖上盖子,彻底混匀(振荡15秒)。在室温下静置5分钟(15-25摄氏度)。注意:如果环境温度超过25摄氏度,无水乙醇需预冷。瞬时离心,以去除管盖上的滴液。1.2.7 将n个核酸提取柱放入收集管中,小心地将步骤1.2.6中的液体移

8、入核酸提取柱中。盖上盖子,6000*g离心1分钟。倒掉收集管中的废液,将提取柱重新放入收集管中。(如果离心后核酸提取柱中仍有部分液体,以更高的速度再次离心,确保提取柱中无残余的液体)1.2.8 小心的打开核酸提取柱的盖子,加入500ul洗液1,盖上盖子,6000*g离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将提取柱重新放入收集管中。1.2.9 小心的打开核酸提取柱的盖子,加入500ul洗液2,盖上盖子,6000*g离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将提取柱重新放入收集管中。1.2.10 小心的打开核酸提取柱的盖子,加入500ul无水乙醇,盖上盖子,6000*g离心1分钟,丢弃收集管,将提取柱放入新的收集管

9、中。1.2.11 20000*g高速离心3分钟,彻底去除乙醇。1.2.12 丢弃收集管,将核酸提取柱放入干净的1.5ml离心管中,打开提取柱的盖子, 56摄氏度温浴3分钟,以彻底去除残余的液体。1.213 将核酸提取柱放入另一干净的1.5ml离心管中,小心打开提取柱的盖子,加入60ul洗脱液(请将洗脱液加到膜的中央),盖上盖子,室温静置5分钟。20000*g高速离心1分钟收集滤出液,做好标记,4摄氏度保存备用。提取的病毒核酸应在2小时内用于PCR扩增,或在-70摄氏度下可以保存一个月。2. 扩增试剂准备(PCR前准备区) 从试剂盒中取出HCV RT-PCR反应液、Enzyme Mix , 在室

10、温下融化后,2000*g离心5秒。设所需要的PCR反应管数(玻璃毛细管)为n(n=样本数+1管空白对照+1管HCV阴性对照+1管HCV强阳性对照+1管HCV临界阳性对照+4管HCV定量标准品),每个测试反应体系配制如下表: 试剂 HCV RT-PCR反应液 Enzyme Mix 用量 n*13ul n*2ul 计算好各试剂的使用量,加入到一适当体积试管中,充分混匀均匀后2000*g离心10秒,向各玻璃毛细管中分装15ul,转移至样本处理区。3. 加样(样本处理区)吸取10ul样本处理步骤1.2.13中收集得到的RNA溶液及HCV定量标准品分别加入到上述反应管中(空白对照直接加入10ul洗脱液)

11、,盖紧反应管管盖,连同Roche专用金属反应管套放在离心机中,于2000*g离心10秒,将毛细管转移到检测区。将毛细管排放好放入荧光PCR检测仪内,记录样本摆放顺序。4. RT-PCR反应(检测区)4.1 循环条件设置ProgramCyclesTemperature摄氏度Incubation Time(min:sec)TemperatureTransitionRate( 摄氏度/sec)AcquisitionModeAnalysisMode1 1 50 30:00 20 NoneNone2 1 95 15:00 20 NoneNone3 45 95 00:05 20 NoneQuantification 50 00:30 20 Single 72 00:20 10None反应体系为25ul.具体设置方法请参照各仪器使用说明书。4.2 仪器检测通道选择选择F1检测通道:HCV内对照(IC)选择F2检测通道。4.3 样本的设定在扩增开始前条件设定时,将HCV定量标准品设为“Standard”并输入试剂盒内给定浓度值,待检样本和对照品设定为“Unknown”。结果分析条件设

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