platon常用功能

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1、PLATON常用功能1-画图(ORTEP格式)常用的有Graphic里的ORTEP/ADP,点击此选项可以画出类似ORTEP要求的图片,但是比ORTEP-3用起来要方便的多Incl-H atoms可以让你选择是否显示H原子Probability 让您选择椭球度(10%-90%)ViewOptions 让您选择程序认为的重叠最少的几个视角,如果还是遮挡,则用RotX,RotY,RotZ来调节LablSize调节标号的大小Decoration 可以让土周围的那些字去掉(点一下您就知道了)最后画完了,点击b&w-EPS-col,点击时,偏左即选择黑白,偏右即彩色这时在您的数据所在的原文件夹中产生一个

2、.ps各式的文件,用photoshop 等软件打开即可。Platon常用功能2-计算晶体结构及结果的读取计算起来比较方便,用calc all 功能即可结果保存在platon.lis或platon.lst文件中但是数据读起来非常麻烦为了方便大家使用,我们列出了最常见的六种结果,给大家提供了搜索词,需要计算这些结果的,只需要在用写字板或记事本打开文件后,用查找功能查找这些词就可以了1. 元素的热振动因子情况统计:搜索词:Averages per Element示例:- Non-H C H Eu N O-Average0.0502 0.0528 0.0677 0.0312 0.0410 0.0501

3、Minimum0.0282 0.0282 0.0250 0.0312 0.0379 0.0321Maximum0.1410 0.1410 0.1692 0.0312 0.0485 0.0909Ratio 5.0000 5.0000 6.7676 1.0000 1.2797 2.8318Number 56 32 32 1 7 162. 计算3元-24元环平面搜索词:Nr示例:-Nr1 P Q R S Sigref0.003 Sigpln0.006 Chisq 8.2 Pl.Hyp. P O(3) - C(21)- C(16)- C(15)- N(3) - sp3 sp2 sp2 sp2 sp2D

4、ev. (Ang) -0.2468 0.1930 -0.0247 -0.0898 0.0361 0.1322Cs(I)-Asym-Par (Deg) 9.47 17.77 27.11 9.47 17.77 27.11C2(I)-Asym-Par (Deg) 41.03 38.18 32.23 41.03 38.18 32.23Ring Bond Angle(Deg) 91.46 125.24 122.00 122.78 127.35 121.97Tors(I-J) (Deg) 33.15 -26.30 1.64 4.54 12.84 -26.10Cs(I-J)-Asym-Par (Deg) 3

5、8.44 28.94 35.98 38.44 28.94 35.98C2(I-J)-Asym-Par (Deg) 7.92 31.08 26.11 7.92 31.08 26.11Ring Bond Distance (Ang) 1.9005 1.3627 1.4050 1.4777 1.2575 2.0189Weighted Average Ring Bond Distance = 1.5704(999,999) Ang. - NOTE: 1st esd. Internal, 2nd esd External.Weighted Average Abs. Torsion Angl. =17.4

6、3( 41,528) Deg. see: e.g. Domenicano et al., Acta Cryst.(1975), B31, 221-234.Cremer & Pople Puckering Parameters-Q(2)= 0.2978 Ang.,Phi(2) =191.7850 DegQ(3)= -0.1922 Ang.: C & P - Puckering Analysis may be DUBIOUS since %(Bond Distance Range/Average) =48.5 25.0 %Puckering Amplitude (Q) = 0.3544 Ang,

7、Theta = 122.84 Deg,Phi =191.7850 Deg说明:该六元环由Cu(1)- O(3) - C(21)- C(16)- C(15)- N(3)组成 计算结果为Puckering Amplitude (Q) = 0.3544 Ang, Theta = 122.84 Deg,Phi =191.7850 Deg 但有时程序不能计算Puckering,如果计算的话就会给出数值。5.pi-pi等弱相互作用搜索词:Short Ring-Interactions示例:=Analysis of Short Ring-Interactions with Cg-Cg Distances 6.0 Angstrom and Beta 60.0 Deg.=

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