连接和转化

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1、连接和转化原理:隆技术(TA cloning)利用Taq聚合酶具有末端转移酶(TdT)活性,但却不具有3-5端外切酶校准活性的特点,可在PCR产物的3端加上一个非模板依赖碱基“A”。pMD18-T是一种高效克隆PCR产物的专用载体,它是由pUC18载体在Xba I和Sal I识别位点间插入一个EcoR V位点,然后用EcoR V进行酶切使质粒线性化,并在它的3端添加“T”构建而成。因其3端带有一个突出的“T”尾,能高效地与带“A”尾的PCR产物连接,极大地提高了克隆的效率。TA克隆是目前克隆PCR产物最简便、快捷的方法。pMD18-T载体结构图TA克隆原理图技术路线 送样要求1. 请提供克隆片

2、段的相关信息,包括名称、大小、样品是否带有“A”尾以及PCR产物是否已纯化。已纯化的PCR产物请确保使用的溶剂为灭菌的双蒸水。2. PCR已纯化样品:浓度20ng/l,体积20l;PCR未纯化样品:浓度50ng/l, 体积25l。所需DNA的总量会随片段大小的不同而有所变化。样品定量检测结果以我们为准。3. 请务必在订单上注明 PCR所用引物序列,以便用于克隆结果的核对分析。4. 当克隆结果中包含合作伙伴提供的单向部分引物序列,我们即视实验成功,将收取全额的实验费用。5. 若序列中包含高GC、Poly等特殊或复杂结构导致测序中断,我们即视实验成功,将收取全额的实验费用。6. 项目完成一个月后,

3、若合作伙伴无要求返还菌液或质粒等,则我们将代为销毁。提供结果1.高纯度质粒,大约2g DNA,OD值在1.80-2.00之间2.含有重组质粒的甘油菌3测序原始图谱和序列4.去载体后的序列5要求测通的样品则提供拼接序列。步骤一、 连接:T4连接前的准备。配LB培养基,每个培养皿(一次性)约20ml。配法(100ml):胰蛋白栋1g;酵母浸粉0.5g;氯化钠0.5g;琼脂1.5g;加NaOH100l(0.01mol/L),调PH=5.8温而不烫时(即121灭菌后,待凝固前或重融), 100微升加入60l的AMP(100mg/mL),然后铺板。T4连接: 目的片段 7l 载体 1l T4 DNase

4、 1l 加完后混匀,顺势离心 T4 buffer 1l16连接过夜(一般16h)转化:取感受态(-80冰箱,吊盒,每管100l),在冰上融化(1min左右),融化后,分出50l加到另一个预先冰浴的离心管中 将连接的10l产物与50l感受态混合,轻弹几下 冰浴5min 加入预先摇床的LB离心管液体培养基800l(应提前将冰箱中的LB在528摇床中摇融,每管1000l,直接吸出800l,用的时候取出) 37恒温摇菌1h 5000rmp离心1min,收集菌体 大约留100l上清液,并用枪头将上清液与菌体混合,此时需加入 lX-gal和 lIPTG混匀 涂板(涂在加AMP的LB培养皿中,每100l加6

5、0lAMP) 37恒温培养过夜。次日挑取白点(用10l的水溶),PCR验证,之后选取正确的菌点摇菌(测序剩下的9l菌液加到50ml离心管中加约10ml的LB液体培养基(AMP抗性)37摇菌过夜)测序并保存(500l菌液+500l甘油,液氮速冻,80保存)。二、 过表达载体的构建(NdeI、SalI)提前准备含AMP、KAN抗性的LB液体和含KAN抗性的固体LB。1、 将含正确序列的大肠杆菌进行摇菌(AMP抗性)提质粒,同时含有pRI201-AN(kan抗性)载体的菌也提质粒。2、 两种质粒分别进行双酶切(NdeI、SalI),跑胶检测并胶回收,双酶切体系,20l 质粒 15l(2纳克即可) 1

6、0H Buffer 2l NdeI 1l 37恒温4h SalI 1l 水 1l3、 目的片段与pRI201-AN载体连接连接体系,10lT4 DNA Polymernase 1lT4 DNA Poly Buffer 1l 混匀,顺式离心,16 水 1l 恒温16hpRI201-AN载体与目的片段 共7l 大片段:小片段=3:18:1pRI201-AN大小 bp,目的基因大小1520bp。(小片段浓度/小片段大小)/(大片段浓度/大片段大小)=38:1。4、 转化:取感受态(每管100l),在冰上在冰上融化(1min左右),融化后,分出50l加到另一个预先冰浴的离心管中 将连接的10l产物与50l感受态混合,轻弹几下(新的离心管要提前冰浴) 冰浴30min 42水浴90s(需准时)冰浴5min 加入预先摇床的LB离心管液体培养基800l(应提前将冰箱中的LB在528摇床中摇融,每管1000l,直接吸出800l,用的时候取出) 37恒温摇菌1h 5000rmp离心1min,收集菌体 大约留100l上清液,并用枪头将上清液与菌体混合 涂板(涂在加AMP的LB培养皿中,每100l加60lAMP) 37恒温培养过夜。

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